More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1714 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  311  2.9999999999999996e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  35.86 
 
 
166 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  34.93 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  33.33 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  33.1 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  35.17 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  33.11 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  34.46 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  36.81 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  36.81 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  32.45 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.37 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.89 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  34 
 
 
149 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.56 
 
 
320 aa  77  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.13 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  35.66 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.54 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  35 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.82 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3237  universal stress protein  33.33 
 
 
296 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  34.27 
 
 
288 aa  71.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  32.19 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  30.41 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  33.56 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.54 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  33.56 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  32.89 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.87 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  35.76 
 
 
154 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  33.12 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  32.45 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  29.17 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.67 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  33.56 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  37.76 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  34.46 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.65 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2453  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
296 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  27.78 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  31.29 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  34.46 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.67 
 
 
290 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
291 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
291 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.99 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  31.33 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  31.08 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  31.33 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  35.81 
 
 
309 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  26.39 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  30.87 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  29.93 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  30.14 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  30.87 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  33.33 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.01 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.8 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.45 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.67 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  30.14 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  29.8 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  26.17 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3008  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
298 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.41 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  34.25 
 
 
280 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  30.14 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.23 
 
 
307 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  32.64 
 
 
301 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.89 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2745  universal stress protein  28.57 
 
 
298 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712229  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  29.87 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  33.77 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.79 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>