276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1707 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  498  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  32.6 
 
 
237 aa  145  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  32.07 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  30.63 
 
 
244 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  29.88 
 
 
238 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  30.2 
 
 
237 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  31.98 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  29.05 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  28.63 
 
 
242 aa  124  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  30.21 
 
 
230 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  30.54 
 
 
235 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  31.88 
 
 
241 aa  122  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  30.43 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  30.43 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  28.63 
 
 
240 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  31.19 
 
 
252 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  32.52 
 
 
270 aa  118  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  30.47 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  30.67 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  27.88 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  29.73 
 
 
252 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  43.55 
 
 
244 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  26.16 
 
 
265 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  28.19 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  30 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  30.57 
 
 
300 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  31.2 
 
 
249 aa  113  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  26.47 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  26.47 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  26.2 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  30.34 
 
 
243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  29.69 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  27.5 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  27.5 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  27.67 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  27.5 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  27.5 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  27.5 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  27.5 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  27.12 
 
 
251 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  26.67 
 
 
295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  27.51 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  28.75 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  28.63 
 
 
253 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  27.08 
 
 
292 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  27.31 
 
 
253 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  27.31 
 
 
255 aa  108  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  41.96 
 
 
240 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  29.82 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  26.78 
 
 
241 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  28.14 
 
 
228 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  28.11 
 
 
301 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  28.17 
 
 
243 aa  108  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  28.14 
 
 
228 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  27.93 
 
 
249 aa  105  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  29.41 
 
 
254 aa  105  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  30.67 
 
 
285 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  28.09 
 
 
236 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  39.82 
 
 
256 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  27.66 
 
 
306 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  27.31 
 
 
266 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  26.27 
 
 
218 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  39.84 
 
 
221 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  28.1 
 
 
237 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  29.61 
 
 
223 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  25.98 
 
 
261 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  30.34 
 
 
247 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  30.7 
 
 
224 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  25.44 
 
 
242 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  40.37 
 
 
227 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  28.32 
 
 
235 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  26.91 
 
 
285 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  27.23 
 
 
306 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  26.91 
 
 
303 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  26.91 
 
 
295 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  28.32 
 
 
235 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  28.11 
 
 
254 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  26.51 
 
 
295 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  26.51 
 
 
295 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  27.43 
 
 
288 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  26.56 
 
 
286 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  26.79 
 
 
245 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  28.83 
 
 
217 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  26.51 
 
 
316 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  27.8 
 
 
318 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  30.13 
 
 
224 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  27.88 
 
 
235 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  28.95 
 
 
224 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  27.88 
 
 
235 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  38.18 
 
 
249 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  25.81 
 
 
238 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  29.27 
 
 
246 aa  99  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  29.27 
 
 
246 aa  99  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  27.43 
 
 
235 aa  99  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  24.69 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  27.62 
 
 
241 aa  98.6  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  28.76 
 
 
268 aa  98.6  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  28.82 
 
 
228 aa  98.6  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  26.99 
 
 
235 aa  98.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  28.11 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>