More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1702 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  410  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 196 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1439  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.187037  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  26.52 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.03 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.03 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.03 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  26.03 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  22.44 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.03 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.03 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  20.51 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  23.97 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 324 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  22.96 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  24.3 
 
 		 224 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 207 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  23.29 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 213 aa  51.2  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 235 aa  51.6  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 286 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  25.85 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  23.32 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  22.45 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  21.92 
 
 		 239 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  25.52 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 269 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  20.51 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>