More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1684 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  33.88 
 
 
255 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  33.2 
 
 
302 aa  122  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
376 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  30.6 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
350 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 
289 aa  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
330 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
261 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
276 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 
280 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
329 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
287 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  40.16 
 
 
307 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
329 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
370 aa  99.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.57 
 
 
251 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  40.18 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  37.01 
 
 
338 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0779  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
311 aa  99  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  30.64 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
244 aa  96.3  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
398 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
1177 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  30.09 
 
 
308 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
1177 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
321 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
320 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
280 aa  92.4  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  27.87 
 
 
332 aa  92  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  39.62 
 
 
316 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
623 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
347 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
1035 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
338 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
347 aa  89.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
307 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
358 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
351 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
343 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1567  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 
363 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  29.36 
 
 
341 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 
315 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
327 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  31 
 
 
266 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
1007 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  31 
 
 
266 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  31 
 
 
266 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
377 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
247 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
311 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
581 aa  86.7  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
350 aa  86.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
256 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 
323 aa  86.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
373 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1841  glycosyl transferase family 2  39 
 
 
313 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
1250 aa  86.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.09 
 
 
853 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
750 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
291 aa  85.5  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
455 aa  85.5  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.11 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  46.53 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
269 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.44 
 
 
853 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
750 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
289 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  27.01 
 
 
260 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
374 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
746 aa  83.6  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3756  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.42 
 
 
853 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.09 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.09 
 
 
851 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.09 
 
 
851 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  25.09 
 
 
851 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.09 
 
 
851 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  25.66 
 
 
785 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.69 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
397 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>