More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1670 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  100 
 
 
297 aa  615  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  40.5 
 
 
292 aa  205  7e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  33.63 
 
 
280 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  29 
 
 
299 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  29 
 
 
299 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 
280 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  26.5 
 
 
280 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  32.52 
 
 
287 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 
297 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  28.09 
 
 
285 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 
291 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  28.05 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  30.14 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  29.22 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 
544 aa  98.2  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  28.06 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  26.29 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  28.23 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  26.24 
 
 
505 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 
340 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  27.43 
 
 
912 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 
378 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  27.92 
 
 
718 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
284 aa  92.4  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 
283 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  30.7 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25.27 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  27.85 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  27.48 
 
 
297 aa  89.7  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 
297 aa  89.7  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  28.84 
 
 
304 aa  89.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  28 
 
 
287 aa  89.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  28.25 
 
 
290 aa  89.4  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 
283 aa  89  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  28.06 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  27.85 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  27.85 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  26.38 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
397 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
289 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  27.27 
 
 
274 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  27.67 
 
 
517 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  26.94 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0312  putative signal transduction protein  32.08 
 
 
270 aa  87  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  27.03 
 
 
274 aa  86.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  27.96 
 
 
292 aa  86.7  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  27.72 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 
282 aa  85.9  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  26.56 
 
 
275 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  24.46 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  30.14 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  24 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  27.82 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  28.35 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  29.08 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  27.45 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  30.1 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  27.92 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  25.74 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  25.74 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0432  putative signal transduction protein  30.16 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.299689  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0413  hypothetical protein  31.07 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 
407 aa  82  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  27.59 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  29.43 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  30.22 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  29.08 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  29.06 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  29.85 
 
 
724 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  29.84 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  22.03 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  25.78 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  27.67 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  26.94 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  26.94 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  26.94 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  25.39 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  25.78 
 
 
256 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  26.15 
 
 
274 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  24.02 
 
 
351 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  25.78 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  28.72 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  25.59 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  28.64 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  26.48 
 
 
425 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  26.05 
 
 
456 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  24.79 
 
 
496 aa  77  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
291 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  27.95 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>