More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1664 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 118 aa  228  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  79.66 
 
 		 118 aa  188  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  79.66 
 
 		 118 aa  188  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  79.66 
 
 		 118 aa  188  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  76.72 
 
 		 117 aa  186  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 118 aa  186  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 118 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 118 aa  186  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 118 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 118 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 118 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 118 aa  184  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 118 aa  184  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  184  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  74.58 
 
 		 118 aa  181  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  74.58 
 
 		 118 aa  181  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  73.73 
 
 		 118 aa  180  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  76.92 
 
 		 117 aa  179  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  76.07 
 
 		 117 aa  178  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  76.07 
 
 		 117 aa  178  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  73.73 
 
 		 119 aa  177  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  73.5 
 
 		 117 aa  177  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  73.73 
 
 		 119 aa  176  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  72.88 
 
 		 119 aa  175  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  72.03 
 
 		 119 aa  174  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 		 119 aa  174  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  73.5 
 
 		 118 aa  173  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  73.5 
 
 		 118 aa  173  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  73.5 
 
 		 118 aa  173  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  72.88 
 
 		 119 aa  173  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  73.5 
 
 		 118 aa  173  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  73.5 
 
 		 118 aa  173  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  73.5 
 
 		 118 aa  173  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  73.5 
 
 		 118 aa  173  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  73.5 
 
 		 118 aa  173  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  73.5 
 
 		 118 aa  173  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  73.5 
 
 		 118 aa  173  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 		 119 aa  173  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  72.88 
 
 		 119 aa  171  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  72.88 
 
 		 119 aa  171  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  72.65 
 
 		 119 aa  170  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  72.03 
 
 		 119 aa  170  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  71.19 
 
 		 119 aa  170  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  71.19 
 
 		 118 aa  169  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  71.19 
 
 		 119 aa  168  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  70.09 
 
 		 118 aa  166  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  75.23 
 
 		 115 aa  166  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  70.34 
 
 		 119 aa  166  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  68.64 
 
 		 119 aa  166  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  68.64 
 
 		 119 aa  166  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  70.34 
 
 		 118 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  71.19 
 
 		 119 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02482  50S ribosomal protein L20  79.66 
 
 		 118 aa  164  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2622  50S ribosomal protein L20  79.66 
 
 		 118 aa  163  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000215786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1823  50S ribosomal protein L20  79.66 
 
 		 118 aa  163  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000424012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1715  50S ribosomal protein L20  79.66 
 
 		 118 aa  163  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000852316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1757  50S ribosomal protein L20  76.42 
 
 		 117 aa  163  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0134124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  69.49 
 
 		 119 aa  163  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  70.34 
 
 		 119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  70.34 
 
 		 119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  68.64 
 
 		 125 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  69.49 
 
 		 119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1891  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2183  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0855617  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 		 118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  69.49 
 
 		 119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 		 118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 121 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  67.52 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01685  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0124084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1926  ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000881806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2147  ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00368004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1475  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00112766  normal  0.994908 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1447  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1958  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000226645  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 		 120 aa  161  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2434  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000769531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1797  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588806  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2009  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.824907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01674  hypothetical protein  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0196333  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1935  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000633644  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  70.34 
 
 		 120 aa  161  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1916  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0615082  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1464  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.41069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1431  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00452751  normal  0.0170461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1837  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264555  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 118 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1954  ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 118 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.228066  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  66.1 
 
 		 121 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1727  50S ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 118 aa  160  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.49225 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0469  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 		 120 aa  160  6e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.667366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  69.23 
 
 		 119 aa  160  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  69.23 
 
 		 119 aa  160  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2050  ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 118 aa  159  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  68.1 
 
 		 117 aa  159  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0215  50S ribosomal protein L20  68.64 
 
 		 119 aa  159  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  66.1 
 
 		 118 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1453  ribosomal protein L20  72.48 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  66.1 
 
 		 118 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>