108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1646 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1646  TniB  100 
 
 		 300 aa  615  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  50.69 
 
 		 298 aa  305  7e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  41.75 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  42.23 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  42.23 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  42.23 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  44.1 
 
 		 303 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  43.07 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  41.89 
 
 		 302 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  39.52 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  39.52 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  38.64 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  39.1 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  37.07 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  38.75 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  39.8 
 
 		 293 aa  216  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  38.41 
 
 		 301 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  39.25 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  39.25 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  39.25 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  39.25 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  35.89 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  39.21 
 
 		 289 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  38.71 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  39.07 
 
 		 307 aa  195  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  36.4 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  35.4 
 
 		 289 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  35.4 
 
 		 289 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  34.72 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  34.72 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  38.37 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  38.37 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  38.37 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  38.37 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  35.48 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  33.56 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  37.24 
 
 		 203 aa  148  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  30.1 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  39.52 
 
 		 497 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  32.23 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  35.5 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  30.03 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  23.94 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  31.38 
 
 		 377 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  35.29 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  28.62 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  35.35 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  27.24 
 
 		 345 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  27.24 
 
 		 345 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  28.33 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  28.33 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  28.33 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  25.73 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  25.73 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  25.73 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  25.73 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  25.82 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  26.09 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  28.7 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  27.84 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  23.72 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  27.56 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  27.56 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  22.69 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  23.17 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  24 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  40 
 
 		 98 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  26.22 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  23.58 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  24.17 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  25.52 
 
 		 536 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  27.35 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  23.63 
 
 		 568 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  23.69 
 
 		 467 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  25.21 
 
 		 551 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  24.19 
 
 		 550 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  23.32 
 
 		 552 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  24.29 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  25.54 
 
 		 335 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0497  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0883  hypothetical protein  24.42 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  26.16 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  22.68 
 
 		 565 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  27.54 
 
 		 530 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  23.32 
 
 		 545 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  27.57 
 
 		 552 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  25.43 
 
 		 275 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  24.6 
 
 		 342 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  25.47 
 
 		 559 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  28.18 
 
 		 338 aa  46.2  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  22.44 
 
 		 546 aa  45.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  24.35 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  24.35 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  27.69 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  24.83 
 
 		 562 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  25.4 
 
 		 551 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  25.4 
 
 		 551 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  22.61 
 
 		 500 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0029  transposition helper protein  24.87 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  19.43 
 
 		 488 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>