285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1638 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1638  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
209 aa  433  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00770043  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004227  octanoate-[acyl-carrier-protein]-protein-N- octanoyltransferase  56.86 
 
 
220 aa  234  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  2.31315e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  60.67 
 
 
215 aa  233  2e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  54.46 
 
 
218 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  59.89 
 
 
215 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01212  lipoate-protein ligase B  55.88 
 
 
220 aa  228  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3029  lipoate-protein ligase B  59.09 
 
 
216 aa  227  7e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572663  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  58.99 
 
 
218 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  59.32 
 
 
216 aa  227  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  59.32 
 
 
215 aa  227  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  58.99 
 
 
218 aa  226  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  59.32 
 
 
215 aa  224  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  57.38 
 
 
219 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  54.92 
 
 
217 aa  222  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  54.92 
 
 
217 aa  222  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.34389e-05  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  54.92 
 
 
217 aa  222  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  58.52 
 
 
216 aa  221  5e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2408  lipoate-protein ligase B  59.44 
 
 
212 aa  221  5e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0980  lipoate-protein ligase B  53.16 
 
 
228 aa  221  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  56.28 
 
 
219 aa  221  8e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3281  lipoate-protein ligase B  57.39 
 
 
217 aa  220  1e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00157558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3459  lipoate-protein ligase B  57.39 
 
 
217 aa  220  1e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.139271  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1086  lipoate-protein ligase B  57.39 
 
 
217 aa  220  1e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  3.59181e-05  hitchhiker  8.77638e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3323  lipoate-protein ligase B  57.39 
 
 
217 aa  220  1e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00233986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  59.66 
 
 
222 aa  219  2e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  53.96 
 
 
203 aa  219  2e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  50.75 
 
 
219 aa  218  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  9.23711e-06  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2500  lipoate-protein ligase B  51.49 
 
 
218 aa  218  8e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  53.23 
 
 
216 aa  217  8e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  56.25 
 
 
216 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12120  lipoate-protein ligase B  51.2 
 
 
217 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1112  lipoate-protein ligase B  51.2 
 
 
217 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  50.75 
 
 
219 aa  216  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.05489e-05 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1165  lipoyltransferase  56.35 
 
 
213 aa  216  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  54.73 
 
 
232 aa  216  3e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.29456e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  54.23 
 
 
233 aa  216  3e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.57866e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  54.23 
 
 
233 aa  214  6e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1710  lipoate-protein ligase B  48.53 
 
 
235 aa  214  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.905957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3155  lipoate-protein ligase B  50 
 
 
219 aa  213  1e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.90793e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  57.54 
 
 
227 aa  213  2e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  49.75 
 
 
220 aa  213  2e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0868  lipoate-protein ligase B  56.82 
 
 
227 aa  212  3e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1988  lipoate-protein ligase B  53.89 
 
 
215 aa  211  5e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  54.24 
 
 
215 aa  211  6e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  56.25 
 
 
218 aa  211  6e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01650  Lipoate-protein ligase B  54.49 
 
 
223 aa  211  8e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00106577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0795  lipoate-protein ligase B  54.49 
 
 
213 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0561601  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  56.42 
 
 
227 aa  209  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  9.26852e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  54.49 
 
 
213 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  54.49 
 
 
213 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.35576e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  49.75 
 
 
224 aa  208  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  54.49 
 
 
213 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  54.49 
 
 
213 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  53.16 
 
 
213 aa  208  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.05703e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  53.16 
 
 
213 aa  208  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.4187e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  53.16 
 
 
213 aa  208  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  53.16 
 
 
213 aa  208  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  53.16 
 
 
213 aa  208  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.62879e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  53.16 
 
 
213 aa  208  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  53.16 
 
 
213 aa  208  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.04863e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  53.16 
 
 
213 aa  208  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  53.68 
 
 
213 aa  207  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  55.62 
 
 
219 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.17999e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2969  lipoate-protein ligase B  52.79 
 
 
244 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  53.3 
 
 
214 aa  206  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  52.78 
 
 
224 aa  205  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  52.2 
 
 
205 aa  204  9e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  47.57 
 
 
207 aa  203  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1087  lipoate-protein ligase B  50.25 
 
 
229 aa  202  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183357  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  52.84 
 
 
218 aa  202  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  50 
 
 
236 aa  202  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1554  lipoate-protein ligase B  49.26 
 
 
217 aa  201  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00660992  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0316  lipoate-protein ligase B  50.54 
 
 
218 aa  197  1e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.152256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  50.28 
 
 
217 aa  196  2e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  46.05 
 
 
214 aa  195  5e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1264  lipoate-protein ligase B  53.29 
 
 
211 aa  194  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0529911  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  44.71 
 
 
257 aa  194  8e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  44.71 
 
 
254 aa  194  8e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  44.71 
 
 
255 aa  194  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  44.71 
 
 
249 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  44.71 
 
 
252 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  44.71 
 
 
249 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  44.71 
 
 
249 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3792  lipoate-protein ligase B  52.41 
 
 
205 aa  194  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  44.71 
 
 
246 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1669  lipoyltransferase  51.89 
 
 
214 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0237  lipoate-protein ligase B  51.4 
 
 
227 aa  192  2e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.543697  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  49.71 
 
 
199 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  53.37 
 
 
222 aa  190  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  52.57 
 
 
226 aa  189  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  52.57 
 
 
226 aa  189  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  49.14 
 
 
199 aa  189  3e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1350  lipoate-protein ligase B  51.87 
 
 
242 aa  188  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0666448  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1413  lipoate-protein ligase B  51.87 
 
 
242 aa  188  5e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000174244  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0503  lipoate-protein ligase B  49.47 
 
 
241 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.052969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4213  lipoate-protein ligase B  48.94 
 
 
241 aa  185  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2199  lipoate-protein ligase B  46.89 
 
 
212 aa  185  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0165634 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2569  lipoate-protein ligase B  46.89 
 
 
212 aa  185  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1967  lipoate-protein ligase B  47.03 
 
 
233 aa  185  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2898  lipoate-protein ligase B  47.12 
 
 
248 aa  179  3e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>