274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1582 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 385 aa  793    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  37.17 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  35.09 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  34.64 
 
 		 392 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  34.57 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  32.09 
 
 		 399 aa  203  5e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  31.4 
 
 		 392 aa  188  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  33.51 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  32.97 
 
 		 377 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  31.68 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  30.91 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  29.69 
 
 		 395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  32.34 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0507  ribonuclease D  32.24 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  32.01 
 
 		 386 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  31.64 
 
 		 393 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  30.89 
 
 		 389 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47460  ribonuclease D  31.9 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  29.77 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  29.06 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  29.06 
 
 		 384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  32.05 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3518  ribonuclease D  30.1 
 
 		 379 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  32.05 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  28.75 
 
 		 394 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1890  ribonuclease D  30.75 
 
 		 401 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239057  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  30.23 
 
 		 395 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1064  ribonuclease D (rnase d)  37.41 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409138  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  31.66 
 
 		 381 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  34.64 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  33.69 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  30.47 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1752  ribonuclease D  31.35 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00607213  normal  0.281233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  34.64 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  34.64 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  34.29 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  34.29 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  34.29 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  34.64 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  30.65 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  30.34 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  30.43 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  28.98 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  34.64 
 
 		 369 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  34.92 
 
 		 369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  29.77 
 
 		 396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  31.07 
 
 		 384 aa  166  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  29.5 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0736  ribonuclease D  34.69 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0989413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  30.21 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  34.63 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  31.23 
 
 		 377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  31.23 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  29.5 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  35.71 
 
 		 368 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0672  Ribonuclease D  27.86 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  28.72 
 
 		 384 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  33.92 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618336  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  30.68 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  29.17 
 
 		 385 aa  159  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  32.07 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  29.41 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  34.88 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000054851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32970  ribonuclease D protein  30.83 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789666  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  27.82 
 
 		 384 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  30.5 
 
 		 375 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  30.95 
 
 		 375 aa  157  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1461  ribonuclease D  30.68 
 
 		 375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  28.42 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  30.5 
 
 		 375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  30.5 
 
 		 375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1668  ribonuclease D  30.11 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0680665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  33.67 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  28.72 
 
 		 382 aa  156  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  30.5 
 
 		 375 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  30.69 
 
 		 375 aa  155  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  30.69 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1734  ribonuclease D  30.25 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  30.69 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  34.06 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  30.42 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  30.42 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  30.42 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  28.05 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  30.24 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1971  ribonuclease D  29.74 
 
 		 385 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0679  ribonuclease D  29.74 
 
 		 385 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  28.42 
 
 		 385 aa  153  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  29.03 
 
 		 385 aa  152  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0869  ribonuclease D  30.15 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  30.75 
 
 		 371 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  30.24 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  27.78 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  30.75 
 
 		 371 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  27.97 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1626  ribonuclease D  34.04 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000103666  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1937  ribonuclease D  29.92 
 
 		 374 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2013  ribonuclease D  30.58 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000328628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  33.11 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2124  ribonuclease D  30.58 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0137564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>