73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1574 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1574  copper resistance B precursor  100 
 
 
235 aa  480  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2115  copper resistance B precursor  97.02 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3545  copper resistance B precursor  42.86 
 
 
237 aa  210  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0320075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1970  copper resistance B precursor  45.81 
 
 
237 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4288  copper resistance B precursor  46.73 
 
 
237 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.28688  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0250  copper resistance B precursor  46.73 
 
 
237 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2217  copper resistance B precursor  46.27 
 
 
363 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0429936  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0013  copper resistance B precursor  45.77 
 
 
371 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.188743  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0013  copper resistance B precursor  45.77 
 
 
371 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.001908  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0015  copper resistance B precursor  45.77 
 
 
371 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0966383  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5182  copper resistance B precursor  45.27 
 
 
371 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336515  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1712  copper resistance B precursor  43.28 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1494  copper resistance B precursor  46.5 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196943  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5379  copper resistance B precursor  44.28 
 
 
369 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3415  copper resistance B precursor  47.29 
 
 
298 aa  182  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0573  copper resistance B precursor  43.78 
 
 
311 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3232  copper resistance protein B  46.27 
 
 
397 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3811  copper resistance B precursor  48.13 
 
 
301 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37810  copper resistance protein B precursor  45.77 
 
 
351 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0815776  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1325  copper resistance protein B  39.29 
 
 
288 aa  168  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282385  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2351  copper resistance B precursor  43.55 
 
 
398 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5670  copper resistance protein B  41.59 
 
 
360 aa  164  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366564  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0202  copper resistance B precursor  42.78 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0381  copper resistance B precursor  38.65 
 
 
353 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3915  copper resistance protein B  41.79 
 
 
258 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0657  copper resistance protein B  43 
 
 
346 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  44.92 
 
 
421 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00270  Copper resistance B precursor  37.04 
 
 
323 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  44.39 
 
 
429 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  40.76 
 
 
495 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1570  copper resistance B precursor  40.3 
 
 
302 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.729928  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1234  copper resistance B precursor  41.67 
 
 
326 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3106  copper resistance B precursor  40 
 
 
341 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37471  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0449  copper resistance B precursor  41.18 
 
 
326 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835872  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2339  copper resistance B precursor  40.1 
 
 
343 aa  154  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254235  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3256  copper resistance B precursor  42.02 
 
 
318 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.27948  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1946  putative copper resistance protein B  41.05 
 
 
287 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.300672  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5375  copper resistance B precursor  39.57 
 
 
306 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1376  copper resistance B precursor  37.45 
 
 
247 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2220  copper resistance B precursor  37.25 
 
 
341 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205984  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2488  copper resistance B precursor  41.21 
 
 
337 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519855  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1720  copper resistance B precursor  42.25 
 
 
324 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.099384  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5337  copper resistance B precursor  42.25 
 
 
324 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931181  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1778  copper resistance B precursor  43.32 
 
 
332 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104151  normal  0.145157 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3622  copper resistance B precursor  35.92 
 
 
305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2205  copper resistance B precursor  35.82 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03131  copper resistance protein B  38.92 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2491  copper resistance B precursor  35.92 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1827  copper resistance B precursor  38.42 
 
 
291 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193991  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2421  copper resistance B precursor  38.16 
 
 
403 aa  145  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0273  copper resistance B precursor  36.79 
 
 
274 aa  145  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0785  copper resistance B precursor  36.27 
 
 
321 aa  144  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.969863  normal  0.401852 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2930  copper resistance B precursor  37.43 
 
 
347 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2135  copper resistance B precursor  37.63 
 
 
351 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1482  copper resistance B precursor  38.17 
 
 
272 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000648661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2204  copper resistance protein B, putative  36.95 
 
 
294 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4396  copper resistance B precursor  37.89 
 
 
256 aa  138  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523353  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4266  copper resistance B precursor  38.86 
 
 
249 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  decreased coverage  0.00992965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0347  copper resistance B precursor  33.62 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.515255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1267  copper resistance B precursor  40.59 
 
 
303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00955945  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0189  putative copper resistance protein CopB precursor  35.92 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00404  hypothetical protein  36.82 
 
 
235 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1708  copper resistance B precursor  35.71 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00160337  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0109  copper resistance protein B precursor  32.37 
 
 
289 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0127  copper resistance B precursor  39.23 
 
 
246 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2630  copper resistance B precursor  33.51 
 
 
313 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0093  copper resistance B precursor  32.54 
 
 
314 aa  121  8e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2457  copper resistance B precursor  35.61 
 
 
323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379097  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0711  copper resistance B precursor  31.55 
 
 
354 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.136599 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0696  putative copper-resistance protein CopB  31.28 
 
 
384 aa  105  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000706782  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1590  copper-resistance protein CopB  30.81 
 
 
339 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266353  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  22.47 
 
 
803 aa  55.1  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  19.34 
 
 
1064 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>