More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1533 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1533  sulphate transporter  100 
 
 		 525 aa  1060    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  56.09 
 
 		 540 aa  568  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2303  sulphate transporter  53.23 
 
 		 519 aa  560  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1592  sulphate transporter  55.79 
 
 		 519 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.795484  normal  0.0437766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2505  sulphate transporter  55.32 
 
 		 519 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2635  sulphate transporter  55.15 
 
 		 518 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000740978  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2031  sulphate transporter  56.12 
 
 		 518 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.62655  normal  0.79554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1709  sulphate transporter  54.18 
 
 		 519 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000377165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1231  TonB-dependent receptor  55.34 
 
 		 521 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1706  sulphate transporter  54.18 
 
 		 519 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000026912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2658  sulphate transporter  54.37 
 
 		 519 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000674443  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1749  sulphate transporter  54.37 
 
 		 519 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000311132  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4141  sulfate permease family protein  55.97 
 
 		 509 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.284646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1990  sulphate transporter  53.23 
 
 		 518 aa  535  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638858  normal  0.0857546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0608  sulphate transporter  54.65 
 
 		 521 aa  533  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000167283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0005  sulphate transporter  51.61 
 
 		 511 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1315  sulphate transporter  53.99 
 
 		 520 aa  527  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2568  sulphate transporter  54.18 
 
 		 519 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.612653  normal  0.477584 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03661  Sulfate permease family protein  53.13 
 
 		 521 aa  521  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2406  sulphate transporter  53.99 
 
 		 525 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.181309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02920  hypothetical protein  54.63 
 
 		 519 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2476  sulphate transporter  54.18 
 
 		 525 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2232  putative sulfate transporter  54.94 
 
 		 515 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2208  sulphate transporter  52.53 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002987  sulfate permease  54.74 
 
 		 504 aa  508  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1617  sulfate permease family protein  53.98 
 
 		 521 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0125947  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0394  sulphate transporter  53 
 
 		 512 aa  491  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3208  sulphate transporter  50.48 
 
 		 540 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1261  sulphate transporter  50.67 
 
 		 515 aa  479  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12953  Sulfate permease family protein  49.52 
 
 		 509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.215491  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1838  sulphate transporter  46.92 
 
 		 509 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2067  sulfate transporter  51.36 
 
 		 534 aa  464  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1105  sulphate transporter  47.21 
 
 		 541 aa  465  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1650  sulphate transporter  45.92 
 
 		 511 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4452  sulphate transporter  45.98 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248248  normal  0.0871975 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2321  sulphate transporter  52.33 
 
 		 536 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4452  sulphate transporter  47.46 
 
 		 495 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000256302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0671  sulfate transporter  44.04 
 
 		 510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.045325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2681  sulphate transporter  45.54 
 
 		 504 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.529175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  44.75 
 
 		 509 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0343473 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0911  sulphate transporter  45.84 
 
 		 539 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.791463  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1689  sulphate transporter  45.77 
 
 		 539 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0223  sulphate transporter  45.77 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.836452  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3363  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  46.26 
 
 		 481 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3557  sulphate transporter  46.25 
 
 		 481 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3685  sulphate transporter  46.26 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0439224  normal  0.0112411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1752  sulphate transporter  46.87 
 
 		 480 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.516323  normal  0.0556997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3386  sulphate transporter  45.86 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3593  sulfate permease family protein  45.44 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41950  sulphate transporter  48.18 
 
 		 481 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32829  SulP family transporter: sulfate; sulfate transporter of the Major Facilitator Superfamily (MFS)  45.09 
 
 		 509 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5067  sulfate permease  40.24 
 
 		 496 aa  352  8.999999999999999e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4649  sulfate permease family protein  39.44 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000779975  unclonable  1.77501e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0549  sulphate transporter  40.97 
 
 		 483 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4472  sulfate transporter  39.69 
 
 		 492 aa  345  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0760011  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4600  sulfate transporter  39.69 
 
 		 492 aa  345  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000140835  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2773  sulphate transporter  41.91 
 
 		 499 aa  344  2e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2200  sulfate permease  39.11 
 
 		 487 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0689  sulfate permease family protein  38.63 
 
 		 483 aa  343  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0381157  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4197  antisigma-factor antagonist, STAS  41.72 
 
 		 496 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0851  sulphate transporter  40.45 
 
 		 502 aa  342  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.819336  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3460  UspA domain-containing protein  41.2 
 
 		 496 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.833239  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0564  sulfate transporter  39.44 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0031948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0565  sulfate transporter  39.44 
 
 		 483 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0710  sulfate permease family protein  39.24 
 
 		 483 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.152209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0226  sulphate transporter  39.92 
 
 		 484 aa  336  5.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660997  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0567  sulphate transporter  38.63 
 
 		 492 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0782  sulfate permease family protein  39.03 
 
 		 483 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0780  sulphate transporter  38.75 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3036  sulphate transporter  40.32 
 
 		 496 aa  335  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0621  sulfate permease family protein  39.03 
 
 		 483 aa  334  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.822382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0653  sulfate permease family protein  39.03 
 
 		 483 aa  334  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2563  sulfate transporter  39.22 
 
 		 495 aa  333  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.542829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2719  sulphate transporter  40.73 
 
 		 497 aa  333  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0721  sulfate permease family protein  38.63 
 
 		 483 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3344  sulphate transporter  40.25 
 
 		 496 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4143  sulphate transporter  40.33 
 
 		 496 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5890  sulfate permease  39.33 
 
 		 493 aa  329  7e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4257  antisigma-factor antagonist STAS  39.92 
 
 		 496 aa  329  9e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0183  putative sulfate transporter  38.93 
 
 		 495 aa  326  7e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1853  sulphate transporter  40.04 
 
 		 496 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.770429  hitchhiker  0.00215909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1911  sulphate transporter  39.96 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42059  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0175  sulphate transporter  37.99 
 
 		 500 aa  323  6e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.672348  normal  0.30485 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0945  sulfate transporter  38.79 
 
 		 495 aa  318  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0235468  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3926  sulphate transporter  41.63 
 
 		 492 aa  319  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0884886  normal  0.213644 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2344  sulphate transporter  37.2 
 
 		 499 aa  318  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2041  SulP family sulfate permease  36.94 
 
 		 499 aa  317  3e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1167  sulphate transporter  38.3 
 
 		 496 aa  317  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.422162  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0019  sulphate transporter  38.38 
 
 		 514 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3643  sulphate transporter  40.29 
 
 		 501 aa  316  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5170  sulphate transporter  38.41 
 
 		 495 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2669  putative sulfate transporter  38.22 
 
 		 495 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1049  sulphate transporter  39.87 
 
 		 500 aa  313  5.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.272014  hitchhiker  0.000191113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2764  sulphate transporter  37.57 
 
 		 499 aa  313  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02670  hypothetical protein  37.81 
 
 		 496 aa  312  7.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3936  sulphate transporter  39.88 
 
 		 501 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.529754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0374  sulphate transporter  40.25 
 
 		 498 aa  311  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0078  sulphate transporter  36.86 
 
 		 506 aa  310  5e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.566328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4067  sulphate transporter  39.29 
 
 		 502 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0186  sulphate transporter  39.16 
 
 		 496 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>