More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1488 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  100 
 
 		 401 aa  838    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2848  ketohexokinase  44.95 
 
 		 290 aa  259  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  38.25 
 
 		 420 aa  251  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  42.76 
 
 		 290 aa  250  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  39.73 
 
 		 292 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  38.68 
 
 		 292 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10054  conserved hypothetical protein  33.66 
 
 		 317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  26.67 
 
 		 314 aa  97.4  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  27.12 
 
 		 298 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  27.12 
 
 		 298 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  27.12 
 
 		 298 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  27.12 
 
 		 298 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  26.78 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  26.78 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  26.78 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  26.78 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  26.78 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  26.44 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  26.1 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36053  predicted protein  27.27 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.630596  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  26.32 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  27.24 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  24.11 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  25.08 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  25.09 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  25.71 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  24.48 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  25.08 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  24 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.76 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  25.52 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  24.3 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  23.81 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  24.66 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  21.65 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  21.99 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  24.05 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  23.43 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  25.86 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  25 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  23 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  24.91 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  23.99 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  22.87 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  22.54 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 		 108 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  21.77 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  22.18 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  21.31 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0252  PfkB domain protein  19.87 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  22.18 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  22.3 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  24.26 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.59 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  24.11 
 
 		 310 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  23.36 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  24.13 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.19 
 
 		 111 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  24.26 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  22 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.26 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  22.68 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  23.1 
 
 		 290 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  24.83 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  22.97 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  25 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  24.26 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  24.51 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  24.26 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  24.26 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  24.49 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  22.92 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  23.84 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  24.49 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  24.83 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  24.49 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  30.77 
 
 		 117 aa  60.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  28.11 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  23.2 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  21.45 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  25.73 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  24.49 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  24.47 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.59 
 
 		 109 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.43 
 
 		 104 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.15 
 
 		 111 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  31.86 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  23.97 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  25.83 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  23.92 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  25.54 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  22.56 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  22.74 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>