101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1477 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1477  flageller protein FlgA  100 
 
 
245 aa  497  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.16 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.1 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.49 
 
 
252 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  29.1 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.76 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.63 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.63 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.63 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.71 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.23 
 
 
232 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  23.31 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.65 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.669338  normal  0.182462 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1540  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.31 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.84 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0919764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06151  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.84 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000222326  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  24.36 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1175  SAF domain-containing protein  24.35 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  27.16 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  24.19 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.15 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  26.09 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.7 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1067  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  30.18 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0500277 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  27.82 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  25 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  24.53 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1158  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.74 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.623618  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  30.46 
 
 
281 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3372  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.39 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  31.69 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.58 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3652  flageller protein FlgA  26.63 
 
 
222 aa  62.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.95 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2965  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.73 
 
 
235 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.639269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3788  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.87 
 
 
358 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.09068  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2950  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.73 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.892014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02933  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.37 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870868  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.73 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3469  SAF domain-containing protein  26.74 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1413  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.18 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1473  putative flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  26.92 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1682  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 
366 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1337  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  22.17 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.18 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1300  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.4 
 
 
235 aa  58.5  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2600  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.72 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0076  SAF domain-containing protein  25.54 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1318  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  22.94 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3090  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.27 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.292219  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0070  SAF domain-containing protein  24.48 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0228  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.26 
 
 
282 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.531559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0718  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.07 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.79 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1256  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.63 
 
 
235 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1326  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.63 
 
 
235 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1430  flagellar basal body P-ring formation protein FlgA  28.12 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.1 
 
 
160 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  22.34 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.460047  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3972  SAF domain-containing protein  25.58 
 
 
245 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.79 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2560  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.19 
 
 
326 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1505  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  38.82 
 
 
370 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0183  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  24.12 
 
 
257 aa  52  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1342  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.14 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.127049  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4424  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.8 
 
 
342 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1621  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  37.18 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.99379  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0570  SAF domain-containing protein  24.18 
 
 
281 aa  49.3  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.14 
 
 
355 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1382  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.29 
 
 
373 aa  48.5  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0036  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  37.18 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22865  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1667  SAF domain-containing protein  37.18 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0285706  normal  0.0223533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3270  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.37 
 
 
348 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132076  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0741  flagellar protein FLGA precursor  25.62 
 
 
159 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1948  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.63 
 
 
314 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68378  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1795  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  22.28 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3046  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.16 
 
 
348 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3244  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  34.15 
 
 
348 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3099  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  25.13 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0595  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25 
 
 
326 aa  46.2  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4196  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.03 
 
 
347 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4670  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.16 
 
 
252 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2735  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  23.53 
 
 
255 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000036483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.56 
 
 
246 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3713  flageller protein FlgA  21.98 
 
 
246 aa  45.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1120  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.12 
 
 
380 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3450  SAF domain-containing protein  26.32 
 
 
238 aa  45.4  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  30.68 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1979  flageller protein FlgA  25.73 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3475  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  21.62 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  0.226708 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1146  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.74 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000705954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0748  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.42 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.14 
 
 
141 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  23.74 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.79 
 
 
139 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4192  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.9 
 
 
140 aa  42.4  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.78 
 
 
237 aa  42  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594164  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1251  SAF domain-containing protein  28.03 
 
 
280 aa  42  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.792381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>