More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1476 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  100 
 
 		 324 aa  661    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  48.03 
 
 		 313 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  48.09 
 
 		 309 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  48.09 
 
 		 310 aa  295  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  48.25 
 
 		 310 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  47.48 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  48.43 
 
 		 310 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  48.11 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  44.87 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  47.19 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  47.6 
 
 		 311 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  46.5 
 
 		 308 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  47.6 
 
 		 311 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  46.5 
 
 		 308 aa  285  8e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  46.84 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  47.6 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  47.6 
 
 		 311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  47.13 
 
 		 308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  47.77 
 
 		 311 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  46.79 
 
 		 316 aa  281  8.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  48.47 
 
 		 312 aa  281  9e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  46.82 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  46.82 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  46.82 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  45.05 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  46.5 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  47.12 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  47.4 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  46.1 
 
 		 307 aa  277  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  46.75 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  46.75 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  46.43 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  46.77 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  45.78 
 
 		 306 aa  276  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  46.43 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  45.74 
 
 		 313 aa  275  8e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  46.43 
 
 		 306 aa  275  8e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  46.13 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  45.13 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  47.63 
 
 		 311 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  46.13 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  46.13 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  46.13 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  44.89 
 
 		 314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  45.2 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  45.2 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  45.2 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  45.4 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  45.31 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  43.44 
 
 		 313 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  46.43 
 
 		 306 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  44.69 
 
 		 317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  45.2 
 
 		 314 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  44.89 
 
 		 314 aa  272  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  45.4 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  44.06 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  45.4 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  46.06 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  45.4 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  47.8 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  44.48 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  45.48 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  43.75 
 
 		 313 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  43.87 
 
 		 308 aa  269  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  45.26 
 
 		 313 aa  268  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  44.65 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  45.13 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  43.83 
 
 		 306 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  46.75 
 
 		 314 aa  265  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  45.13 
 
 		 306 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  42.07 
 
 		 319 aa  256  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  42.63 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  42.58 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  44.87 
 
 		 309 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  43.53 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  38.53 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  39.31 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  43.15 
 
 		 248 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  37.5 
 
 		 318 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  35.76 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  36.62 
 
 		 316 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  36.31 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  36.39 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  36.39 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  34.72 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1763  putative CheW protein  36.88 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  38.64 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  34.72 
 
 		 298 aa  185  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  37.54 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  36.76 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  36.16 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  37.74 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  34.05 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  34.47 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  32.99 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3759  response regulator receiver modulated CheW protein  35.56 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00050568  normal  0.01011 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  34.47 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  34.78 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  33.75 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  34.56 
 
 		 297 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>