More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1460 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  44.44 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  49.47 
 
 		 191 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.82 
 
 		 197 aa  158  7e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.19 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01111  hypothetical protein  37.17 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.238768 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  38.83 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  34.63 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  36.28 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  35.44 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  32.23 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  34.33 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  31.4 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  32 
 
 		 371 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  32.72 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  31.28 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  33.33 
 
 		 190 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  33.33 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  33.65 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  30.69 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  33.51 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  32.2 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  28.71 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  31.53 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  30.15 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  30.15 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  31.55 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  34.63 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  30.93 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  30.29 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  29.05 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  30.48 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  32.2 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  31.75 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  37.59 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  31.28 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  27.84 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  27.57 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  29.77 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  30.05 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  30.6 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  35.71 
 
 		 174 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  27.54 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3101  sialic acid biosynthesis protein NeuD  27.59 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  28.17 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  29.85 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  26.89 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  25.49 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  29.85 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  25.48 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3311  hexapaptide repeat-containing transferase  26.07 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0201996  normal  0.383488 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3119  hexapaptide repeat-containing transferase  24.41 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.022833  hitchhiker  0.00127882 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  25.98 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  29.19 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  27.17 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  34.56 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0284  hexapaptide repeat-containing transferase  27.84 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  34.3 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2576  acetyltransferase  30.2 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.538596  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  33.14 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  35.61 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1764  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylateN- ac etyltransferase  30.77 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  25.84 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  29.8 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14121  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00206  transferase hexapeptide repeat  23.61 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1222  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  31.25 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0668  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  33.87 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  30.94 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  31.2 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  25.12 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  25.81 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  36.67 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2356  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  23.19 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  31.85 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  32.43 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0293  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  33.88 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  23.15 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  28.02 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11536  hypothetical protein  23.81 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.315623 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  30.3 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2767  putative serine O-acetyltransferase  27.91 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1814  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2-carboxylate N-succinyltransferase  31.16 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000825508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2186  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  30.47 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2245  pilin glycosylation protein  27.43 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0796956  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  27.32 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  23.58 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1877  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  28.23 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  28.89 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  21.15 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2423  acetyltransferase  32.79 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0613  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  30.47 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  27.49 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  26.17 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  27.51 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1022  Tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain protein  29.51 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  33.05 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0828  acyltransferase  23.36 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.382027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2833  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylateN- ac etyltransferase  32.09 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>