153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1458 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  100 
 
 
334 aa  692    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  59.88 
 
 
333 aa  410  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  56.33 
 
 
331 aa  381  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  54.88 
 
 
334 aa  379  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  54.85 
 
 
333 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  53.31 
 
 
330 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  53.66 
 
 
335 aa  358  6e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  50.61 
 
 
334 aa  348  8e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  50 
 
 
334 aa  345  6e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.9 
 
 
338 aa  343  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  52.28 
 
 
333 aa  338  8e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  51.7 
 
 
337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.2 
 
 
332 aa  331  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  51.07 
 
 
349 aa  329  4e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.21 
 
 
334 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.21 
 
 
334 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  46.53 
 
 
337 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  47.88 
 
 
341 aa  316  5e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  48.35 
 
 
333 aa  315  7e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  49.07 
 
 
340 aa  315  8e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  49.07 
 
 
340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  47.85 
 
 
357 aa  308  9e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  46.74 
 
 
363 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  46.13 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  50.63 
 
 
348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  47.28 
 
 
357 aa  302  6.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  47.28 
 
 
357 aa  302  6.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.18 
 
 
359 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  45.35 
 
 
346 aa  297  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.46 
 
 
357 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.4 
 
 
357 aa  291  9e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  46.2 
 
 
347 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  43.45 
 
 
335 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  41.79 
 
 
359 aa  266  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.57 
 
 
350 aa  264  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  41.96 
 
 
341 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  43.18 
 
 
360 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  41.21 
 
 
358 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2396  NeuB, antifreeze-like protein  43.91 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  42.94 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.2 
 
 
350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.13 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  41.3 
 
 
350 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.88 
 
 
342 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.25 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.23 
 
 
338 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  39.09 
 
 
338 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.3 
 
 
394 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37 
 
 
344 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  36.65 
 
 
350 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4853  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.84 
 
 
352 aa  208  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  34.88 
 
 
350 aa  208  9e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  36.02 
 
 
337 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.28 
 
 
351 aa  202  4e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.89 
 
 
354 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  38.27 
 
 
748 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  34.86 
 
 
332 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  37.04 
 
 
343 aa  199  5e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  37.42 
 
 
761 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.01 
 
 
762 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.147767  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  34.86 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1974  N-acetylneuraminate synthase  42.7 
 
 
305 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.56 
 
 
749 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  33.53 
 
 
350 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.04 
 
 
749 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.04 
 
 
749 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  34.06 
 
 
349 aa  186  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.64 
 
 
352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  34.37 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  38.66 
 
 
672 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1894  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.42 
 
 
354 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  33.02 
 
 
338 aa  183  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0910  N-acetylneuraminate synthase  36.07 
 
 
289 aa  182  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  33.23 
 
 
344 aa  179  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.82 
 
 
350 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.1 
 
 
345 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  33.54 
 
 
349 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1072  sialic acid synthase  35.94 
 
 
293 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  35.48 
 
 
303 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1912  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.12 
 
 
365 aa  176  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000713145 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3681  N-acetylneuraminate synthase  33.03 
 
 
344 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.42 
 
 
343 aa  176  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  35.36 
 
 
289 aa  176  7e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1890  N-acetylneuraminate synthase  34.14 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000120962  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  31.86 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1274  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.88 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  37.04 
 
 
343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1158  sialic acid synthase  32.72 
 
 
346 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00143382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.78 
 
 
358 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.42 
 
 
356 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  33.74 
 
 
340 aa  169  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  32.09 
 
 
352 aa  169  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  33.53 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0346  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.81 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  31.15 
 
 
350 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  32.83 
 
 
350 aa  166  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0364  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  31.79 
 
 
358 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.431709  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1574  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.88 
 
 
289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000030231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  30.89 
 
 
351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0843  N-acetylneuraminate synthase  34.89 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>