192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1448 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  100 
 
 		 144 aa  299  9e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  38.89 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  38.02 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  38.52 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  38.1 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  42.11 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  42.11 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  42.11 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  42.11 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  42.11 
 
 		 135 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  39.32 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  35.25 
 
 		 136 aa  97.1  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  31.75 
 
 		 136 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  34.13 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  31.75 
 
 		 136 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  34.96 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  35.38 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  30.16 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0625  flagellar protein FliS  34.65 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  36.51 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  38.84 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  30.16 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  32.52 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  34.92 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  34.71 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.07 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  38.46 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  30.95 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  38.46 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  31.71 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  36.21 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2448  flagellar protein FliS  34.07 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3062  flagellar protein FliS  34.07 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3081  flagellar protein FliS  34.07 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  35.16 
 
 		 138 aa  90.1  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  36.11 
 
 		 141 aa  90.5  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  31.85 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  32.54 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  30.95 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  34.15 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  37.61 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  34.15 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  35.38 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  36.8 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  30.65 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  37.07 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  34.82 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  28.35 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  37.93 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  36 
 
 		 144 aa  87.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  33.08 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  36 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  32.03 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  32.03 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  35.29 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  34.75 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3107  flagellar protein FliS  33.08 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  29.92 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  30.08 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3059  flagellar protein FliS  33.08 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  28.57 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  31.3 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  32.54 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  34.4 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  31.34 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  35.96 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  37.27 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  32.54 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  33.86 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  38.71 
 
 		 286 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  34.55 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  31.67 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  32.8 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  30.37 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  30.37 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  37.84 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  33.04 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2140  flagellar protein FliS  30.37 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0224  flagellar protein FliS  30.37 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  30.37 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3398  flagellar protein FliS  30.37 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  35.45 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  33.61 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  33.61 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  33.61 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  33.61 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  33.61 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  33.61 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.11516 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  33.61 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  36.59 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  32.26 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3567  flagellar protein FliS  30.15 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.530482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  33.85 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0202  flagellar protein FliS  31.11 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  35.45 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0206  flagellar protein FliS  40 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  32.12 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  32.5 
 
 		 130 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>