More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1385 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  100 
 
 
123 aa  249  7e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  58.97 
 
 
127 aa  157  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  55.28 
 
 
123 aa  154  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  54.47 
 
 
125 aa  152  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  54.62 
 
 
137 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  54.17 
 
 
124 aa  149  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  3.64045e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  50 
 
 
131 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  54.55 
 
 
140 aa  147  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  47.54 
 
 
132 aa  145  2e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  47.54 
 
 
132 aa  145  2e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  48.76 
 
 
131 aa  145  2e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  51.22 
 
 
123 aa  142  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  46.72 
 
 
131 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  49.58 
 
 
154 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  50 
 
 
123 aa  141  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  50 
 
 
123 aa  141  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  50.42 
 
 
130 aa  140  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  50.43 
 
 
125 aa  139  2e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  50.43 
 
 
123 aa  138  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  49.57 
 
 
120 aa  137  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  52 
 
 
126 aa  137  4e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  50.43 
 
 
125 aa  137  4e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  47.54 
 
 
126 aa  136  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  48.25 
 
 
121 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  51.67 
 
 
143 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  47.5 
 
 
120 aa  134  3e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  51.33 
 
 
126 aa  134  3e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  50 
 
 
120 aa  134  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  49.57 
 
 
126 aa  134  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  47.79 
 
 
139 aa  134  6e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  44.72 
 
 
123 aa  133  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  3.573e-05  decreased coverage  3.01117e-05 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  49.11 
 
 
153 aa  132  1e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  46.09 
 
 
117 aa  131  4e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  50.82 
 
 
122 aa  130  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  43.9 
 
 
124 aa  130  7e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  48.25 
 
 
120 aa  130  8e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  50.46 
 
 
122 aa  129  1e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  45.08 
 
 
122 aa  128  2e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  49.17 
 
 
149 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  45.38 
 
 
122 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  42.98 
 
 
125 aa  127  4e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  42.15 
 
 
125 aa  127  5e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  49.17 
 
 
120 aa  125  1e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  43.97 
 
 
124 aa  126  1e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  45.38 
 
 
123 aa  125  1e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  43.97 
 
 
124 aa  125  2e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  47.83 
 
 
126 aa  125  2e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  43.97 
 
 
124 aa  125  2e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  43.48 
 
 
124 aa  125  2e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  43.09 
 
 
123 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  46.34 
 
 
130 aa  124  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  44.25 
 
 
123 aa  120  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  46.55 
 
 
123 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  50.46 
 
 
120 aa  119  1e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  119  1e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  48.78 
 
 
121 aa  119  2e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  46.96 
 
 
120 aa  118  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  47.97 
 
 
121 aa  117  5e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  47.15 
 
 
120 aa  117  5e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  47.97 
 
 
121 aa  117  5e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  40.83 
 
 
125 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  44.04 
 
 
123 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  35.4 
 
 
121 aa  102  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  35.4 
 
 
121 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  2.89203e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  39.32 
 
 
121 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  41.96 
 
 
124 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  40.78 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  37.38 
 
 
113 aa  90.9  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  38.24 
 
 
124 aa  90.9  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  39.39 
 
 
140 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  39.39 
 
 
140 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  37.86 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  43.37 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  37.62 
 
 
170 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  39.39 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  38.38 
 
 
170 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  38.38 
 
 
170 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  38.38 
 
 
170 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  38.46 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  37.37 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2251  Thioredoxin domain protein  35.4 
 
 
122 aa  84.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  38.1 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  46.84 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  36.89 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  41.67 
 
 
148 aa  82  2e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  42.7 
 
 
144 aa  82.4  2e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  40.2 
 
 
140 aa  82  2e-15  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  36.27 
 
 
140 aa  82.4  2e-15  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  39.22 
 
 
139 aa  82  2e-15  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  51.32 
 
 
301 aa  82.4  2e-15  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  36.67 
 
 
104 aa  80.9  5e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  37.37 
 
 
105 aa  80.9  5e-15  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  36.8 
 
 
302 aa  80.9  6e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  50 
 
 
146 aa  80.9  6e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  44.16 
 
 
144 aa  80.5  8e-15  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  36.46 
 
 
145 aa  80.5  8e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  38.54 
 
 
139 aa  80.5  8e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  38.54 
 
 
139 aa  80.5  8e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  38.54 
 
 
139 aa  80.5  8e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  38.54 
 
 
139 aa  80.5  8e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>