More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1283 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1283  uridylate kinase  100 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000389997  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  56.9 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  56.9 
 
 		 246 aa  279  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  56.47 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  56.22 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  56.65 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  56.9 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  56.17 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  56.47 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  56.47 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  56.47 
 
 		 247 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  54.94 
 
 		 245 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2595  uridylate kinase  55.36 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  54.94 
 
 		 245 aa  271  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  55.17 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  55.79 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  56.03 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  56.47 
 
 		 236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  56.22 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  56.65 
 
 		 247 aa  265  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  55.84 
 
 		 238 aa  265  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  54.66 
 
 		 237 aa  263  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  56.47 
 
 		 236 aa  263  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  55.08 
 
 		 237 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0565  uridylate kinase  54.74 
 
 		 253 aa  263  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  56.03 
 
 		 236 aa  263  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  55.08 
 
 		 237 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  54.66 
 
 		 237 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  55.08 
 
 		 237 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  55.08 
 
 		 237 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  54.24 
 
 		 286 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  54.24 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  54.24 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  54.24 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  54.24 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  54.24 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  54.24 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  54.66 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  54.66 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  54.66 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  54.66 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  54.66 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2974  uridylate kinase  54.55 
 
 		 249 aa  261  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  55.17 
 
 		 236 aa  261  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  55.17 
 
 		 240 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  56.03 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  55.17 
 
 		 240 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  55.17 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  55.17 
 
 		 240 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  55.17 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00169  uridylate kinase  53.25 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0505974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3432  uridylate kinase  53.25 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0174185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  55.17 
 
 		 236 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3489  uridylate kinase  53.25 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.257153  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0175  uridylate kinase  53.25 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000281467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0182  uridylate kinase  53.25 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0585328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0181  uridylate kinase  53.25 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000366692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0173  uridylate kinase  53.25 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0164  uridylate kinase  53.25 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0156878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  55.17 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0258  uridylate kinase  53.68 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0256  uridylate kinase  53.68 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0243  uridylate kinase  53.68 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0240  uridylate kinase  53.68 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0240  uridylate kinase  53.68 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.432338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  53.25 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  53.25 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3358  uridylate kinase  53.25 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.386876  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  52.81 
 
 		 241 aa  258  7e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  52.59 
 
 		 238 aa  258  8e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  53.25 
 
 		 241 aa  258  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0709  uridylate kinase  52.81 
 
 		 241 aa  257  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  52.38 
 
 		 239 aa  256  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  54.31 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  54.74 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2979  uridylate kinase  53.68 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3163  uridylate kinase  52.38 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  53.88 
 
 		 240 aa  255  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  53.88 
 
 		 236 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  52.38 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  53.88 
 
 		 240 aa  254  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  53.45 
 
 		 245 aa  254  9e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  51.29 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  51.29 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  51.95 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  50.21 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  52.59 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  48.72 
 
 		 235 aa  252  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  51.52 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  52.16 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  49.57 
 
 		 235 aa  250  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2176  uridylate kinase  56.36 
 
 		 237 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  50.43 
 
 		 245 aa  249  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  51.08 
 
 		 243 aa  248  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  51.95 
 
 		 247 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1543  uridylate kinase  50.22 
 
 		 243 aa  248  8e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0610  uridylate kinase  50.22 
 
 		 243 aa  248  8e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.139301  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  51.52 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  50.43 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  51.52 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>