More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1260 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1260  enolase  100 
 
 		 426 aa  857    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  68.38 
 
 		 427 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  69.56 
 
 		 427 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  69.09 
 
 		 427 aa  610  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  68.69 
 
 		 428 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  68.46 
 
 		 428 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  68.22 
 
 		 428 aa  598  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  67.45 
 
 		 427 aa  596  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  69.09 
 
 		 427 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  69.7 
 
 		 430 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  69.3 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  69.3 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  69.3 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  69.3 
 
 		 431 aa  589  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  69.53 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  69.3 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  68.85 
 
 		 427 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  68.46 
 
 		 428 aa  588  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  68.15 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  69.23 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  68.46 
 
 		 428 aa  585  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  69.23 
 
 		 430 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  68.76 
 
 		 430 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1299  phosphopyruvate hydratase  69.01 
 
 		 433 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  67.92 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1554  enolase  68.38 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.384625  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  68.09 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 429 aa  580  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1504  phosphopyruvate hydratase  68.62 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  65.59 
 
 		 433 aa  579  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17320  phosphopyruvate hydratase  68.62 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1612  phosphopyruvate hydratase  67.45 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2515  enolase  67.84 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1636  phosphopyruvate hydratase  65.66 
 
 		 438 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292411  hitchhiker  0.000813655 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  67.13 
 
 		 429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  65.24 
 
 		 422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4063  phosphopyruvate hydratase  67.45 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4165  phosphopyruvate hydratase  67.45 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.654872  normal  0.604317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  67.52 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  69.3 
 
 		 431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1363  phosphopyruvate hydratase  67.92 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 429 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  69.3 
 
 		 431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1166  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1870  phosphopyruvate hydratase  65.43 
 
 		 438 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000338918  hitchhiker  0.000814995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 429 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38790  phosphopyruvate hydratase  67.68 
 
 		 429 aa  574  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  64.25 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 429 aa  569  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0852  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 426 aa  569  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  69.3 
 
 		 431 aa  569  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  69.3 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 428 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 		 426 aa  569  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1121  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 		 431 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 		 431 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02624  phosphopyruvate hydratase  68 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000285005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0909  Phosphopyruvate hydratase  68 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107152  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0593  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 		 428 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0568  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 		 428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.183822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3083  phosphopyruvate hydratase  68 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215953  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0933  phosphopyruvate hydratase  68 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2923  phosphopyruvate hydratase  68 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182866  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1664  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 		 438 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000737356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2917  phosphopyruvate hydratase  68 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0019531  normal  0.702822 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_533  enolase  64.79 
 
 		 428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4039  phosphopyruvate hydratase  68 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102498  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3094  phosphopyruvate hydratase  68 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.269583  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1470  enolase  65.72 
 
 		 425 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02586  hypothetical protein  68 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000255384  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  65.27 
 
 		 431 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3149  phosphopyruvate hydratase  67.29 
 
 		 432 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00318163  normal  0.304263 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3110  phosphopyruvate hydratase  67.29 
 
 		 432 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>