More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1251 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 438 aa  887    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  57.67 
 
 		 436 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  56.39 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  56.16 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  56.62 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  56.16 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  56.16 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  57.44 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  56.16 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  55.71 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  56.62 
 
 		 437 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  53.88 
 
 		 436 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  55.71 
 
 		 434 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  55.71 
 
 		 463 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  54.46 
 
 		 437 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  54.46 
 
 		 437 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  55.68 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  56.16 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  59.59 
 
 		 437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  53.09 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  53.15 
 
 		 442 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  59.74 
 
 		 450 aa  463  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  53.32 
 
 		 435 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  54.88 
 
 		 437 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  51.69 
 
 		 443 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  51.37 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  52.03 
 
 		 442 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  52.03 
 
 		 442 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  52.25 
 
 		 442 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  52.03 
 
 		 442 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  52.03 
 
 		 442 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  51.69 
 
 		 443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  52.74 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  52.4 
 
 		 436 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  55.02 
 
 		 433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  55.84 
 
 		 436 aa  448  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  51.69 
 
 		 443 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  51.37 
 
 		 436 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  51.88 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  51.58 
 
 		 442 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  54.15 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3394  homoserine dehydrogenase  56.85 
 
 		 434 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  52.91 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  52.37 
 
 		 439 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2454  homoserine dehydrogenase  55.26 
 
 		 436 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  51.7 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  52.15 
 
 		 448 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  52.13 
 
 		 439 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  51.03 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  52.83 
 
 		 439 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  50.68 
 
 		 440 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  51.76 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  51.76 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  51.76 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  51.76 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  51.76 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  51.76 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  51.76 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  51.76 
 
 		 442 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2010  homoserine dehydrogenase  52.34 
 
 		 445 aa  421  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000414031  normal  0.35034 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0253  homoserine dehydrogenase  51.99 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000322184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  51.2 
 
 		 436 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0279  homoserine dehydrogenase  51.88 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00103779  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  48.57 
 
 		 452 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  50.44 
 
 		 453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  50.44 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  48.51 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  48.74 
 
 		 436 aa  395  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  49.41 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  47.54 
 
 		 444 aa  395  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  46.56 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  44.37 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  43.68 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 		 436 aa  362  6e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  43.81 
 
 		 436 aa  362  9e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  46.49 
 
 		 439 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  45.39 
 
 		 428 aa  361  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  47.13 
 
 		 423 aa  359  7e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  45.54 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  45.79 
 
 		 438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.53 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  42.56 
 
 		 439 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  45.8 
 
 		 438 aa  350  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  44.94 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  43.05 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  43.05 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  43.88 
 
 		 417 aa  342  1e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 437 aa  339  5e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 		 439 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  45.06 
 
 		 429 aa  339  7e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  43.68 
 
 		 440 aa  338  8e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  44.29 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  43.18 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  42.33 
 
 		 438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  42.18 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  42.14 
 
 		 439 aa  335  7e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  43.48 
 
 		 427 aa  335  7.999999999999999e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  46.71 
 
 		 445 aa  335  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  46.15 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>