More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1241 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 435 aa  899    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  44.39 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  44.73 
 
 		 432 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  45.31 
 
 		 432 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  42.29 
 
 		 426 aa  341  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  43.69 
 
 		 423 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  39.67 
 
 		 427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  42.82 
 
 		 417 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  39.72 
 
 		 476 aa  318  9e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  42.59 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  40.94 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  41.41 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  40.59 
 
 		 424 aa  313  4.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  40.65 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  40 
 
 		 416 aa  305  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  43.79 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  43.09 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  41.13 
 
 		 413 aa  302  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  38.34 
 
 		 425 aa  287  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  39.34 
 
 		 424 aa  286  5.999999999999999e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  36.95 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  38.08 
 
 		 427 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  34.95 
 
 		 418 aa  223  7e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  32.79 
 
 		 411 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  32.79 
 
 		 411 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  31.87 
 
 		 500 aa  206  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  32.32 
 
 		 409 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  31.65 
 
 		 414 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  32.34 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  31.53 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  34.55 
 
 		 496 aa  196  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  31.87 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  32.86 
 
 		 485 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  30.59 
 
 		 484 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  33.33 
 
 		 474 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  30.23 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  31.07 
 
 		 536 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  25.65 
 
 		 489 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  25.11 
 
 		 511 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  25.8 
 
 		 496 aa  97.8  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  24.33 
 
 		 511 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  25.89 
 
 		 512 aa  97.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  25.77 
 
 		 485 aa  96.3  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  24.33 
 
 		 511 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  25.43 
 
 		 511 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  24.71 
 
 		 486 aa  94  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.43 
 
 		 500 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  23.49 
 
 		 499 aa  89.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  23.74 
 
 		 509 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  22.48 
 
 		 496 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  23.68 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  25.16 
 
 		 509 aa  87.4  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  24.48 
 
 		 486 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  25.05 
 
 		 492 aa  86.7  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  25.76 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  24.12 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  24.36 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  25.17 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  24.12 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  24.12 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  25.17 
 
 		 502 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  24.12 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  24.48 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  26.1 
 
 		 499 aa  84.7  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  23.74 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  25.36 
 
 		 501 aa  84.7  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  22.15 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  25.85 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  22.5 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  22.25 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  22.5 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  23.49 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  21.92 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  23.74 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  23.54 
 
 		 518 aa  80.1  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  21.93 
 
 		 506 aa  80.1  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  22.54 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  21.99 
 
 		 488 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  23.83 
 
 		 502 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  24.14 
 
 		 497 aa  79.7  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  24.86 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  22.5 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  21.99 
 
 		 488 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  25.4 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  21.99 
 
 		 488 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  23.77 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  26.02 
 
 		 524 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  23.2 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  24.01 
 
 		 484 aa  77  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  21.79 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  24.94 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  25.82 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  23.74 
 
 		 495 aa  76.6  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  24.06 
 
 		 512 aa  76.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  23.04 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  24.42 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  22.05 
 
 		 505 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  22.22 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  23.62 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  22.22 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>