26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1204 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1204  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  646    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.919148  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10191  predicted protein  48.47 
 
 
295 aa  300  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538025  normal  0.129963 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2347  hypothetical protein  45.79 
 
 
358 aa  282  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2315  hypothetical protein  43.85 
 
 
356 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2077  hypothetical protein  44.26 
 
 
309 aa  271  9e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.520614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0677  hypothetical protein  43.73 
 
 
314 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  44.26 
 
 
318 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  30.07 
 
 
178 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 
181 aa  62.4  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  29.11 
 
 
324 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  31.62 
 
 
366 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  26.13 
 
 
370 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  24.35 
 
 
370 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  21.36 
 
 
374 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  30.38 
 
 
345 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.88 
 
 
370 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.97 
 
 
363 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  28.4 
 
 
345 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  28.4 
 
 
345 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  28.4 
 
 
345 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  30.08 
 
 
377 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  27.36 
 
 
379 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  28.4 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  28.4 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.16 
 
 
350 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>