More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1135 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  781    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.53 
 
 		 907 aa  276  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  36.27 
 
 		 906 aa  255  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  35.03 
 
 		 917 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  36.16 
 
 		 906 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  36.16 
 
 		 906 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.16 
 
 		 906 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  34.16 
 
 		 930 aa  239  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  35.01 
 
 		 912 aa  238  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  35.49 
 
 		 929 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  35.01 
 
 		 912 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  35.29 
 
 		 912 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  35.14 
 
 		 901 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  34.13 
 
 		 926 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  36.9 
 
 		 901 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  34.86 
 
 		 901 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  34.95 
 
 		 904 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  34.03 
 
 		 915 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  35.48 
 
 		 932 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  36.71 
 
 		 924 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  32.9 
 
 		 943 aa  229  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  34.32 
 
 		 901 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  36.34 
 
 		 916 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  37.4 
 
 		 919 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  34.84 
 
 		 927 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  33.87 
 
 		 933 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  35.65 
 
 		 913 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  34.49 
 
 		 914 aa  226  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  35.65 
 
 		 913 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  34.54 
 
 		 925 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  35.38 
 
 		 913 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  32.21 
 
 		 911 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  35.24 
 
 		 927 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  35.38 
 
 		 913 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  31.84 
 
 		 921 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  36.13 
 
 		 911 aa  222  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  36.13 
 
 		 911 aa  222  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  35.67 
 
 		 911 aa  222  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  36.13 
 
 		 911 aa  222  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  36.13 
 
 		 911 aa  222  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  36.13 
 
 		 911 aa  222  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  36.13 
 
 		 911 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  35.34 
 
 		 922 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  36.13 
 
 		 911 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  36.13 
 
 		 911 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  33.33 
 
 		 928 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  35.94 
 
 		 936 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  35.94 
 
 		 936 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  35.65 
 
 		 994 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  32.69 
 
 		 942 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  34.32 
 
 		 1082 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  34.32 
 
 		 1066 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  34.32 
 
 		 1071 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  34.32 
 
 		 1079 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  34.32 
 
 		 1071 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  34.5 
 
 		 908 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  34.97 
 
 		 1017 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 		 1089 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  35.14 
 
 		 927 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  32.05 
 
 		 912 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  32.63 
 
 		 920 aa  212  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  35.33 
 
 		 930 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.64 
 
 		 913 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.89 
 
 		 914 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  33.99 
 
 		 916 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  34.76 
 
 		 921 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  31.07 
 
 		 378 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  32.89 
 
 		 909 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  30.45 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  34.2 
 
 		 918 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  31.52 
 
 		 918 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  32.8 
 
 		 936 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  34.78 
 
 		 922 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 405 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  30.03 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  33.42 
 
 		 942 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  32.58 
 
 		 916 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  34.32 
 
 		 911 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  36.21 
 
 		 930 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  35.04 
 
 		 912 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  28.98 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 376 aa  196  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  30.37 
 
 		 369 aa  193  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 377 aa  192  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.54 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 		 376 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  32.11 
 
 		 935 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 377 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  29.47 
 
 		 376 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  29.46 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 		 376 aa  185  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  31.41 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  29.06 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  29.33 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  26.58 
 
 		 381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  29.38 
 
 		 373 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>