More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1133 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  100 
 
 		 371 aa  746    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  32.46 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  31.58 
 
 		 329 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  32.7 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  30.84 
 
 		 335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  30.84 
 
 		 320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  32.5 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  32.8 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  26.5 
 
 		 425 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  28.82 
 
 		 354 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  32.69 
 
 		 334 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  31.61 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  31.61 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  28.92 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  31.56 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  27.4 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  27.4 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  27.4 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  29.3 
 
 		 398 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  28.81 
 
 		 350 aa  126  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  27.4 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  27.67 
 
 		 355 aa  127  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  27.4 
 
 		 355 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.4 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  27.37 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  29.94 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  29.5 
 
 		 356 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  27.9 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  27.9 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.9 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.9 
 
 		 355 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  29.77 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  30.3 
 
 		 354 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  29 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  29 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  29.08 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  28.77 
 
 		 357 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  31.98 
 
 		 437 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  29.59 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  28.97 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.93 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  27.91 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  28.78 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  27.58 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  28.16 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  30.08 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  28.06 
 
 		 340 aa  114  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  28.79 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  28.62 
 
 		 328 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  28.42 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  28.67 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  28.19 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  28.4 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  25.98 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  25.98 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  26.97 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  28.77 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  27.35 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  36.67 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  26.1 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  27.19 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  28.49 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  38.01 
 
 		 541 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  27.94 
 
 		 342 aa  107  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  26.73 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  29.79 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  29.79 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  29.79 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  25.59 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  26.87 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  29.34 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  29.45 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  42.74 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  29.25 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  27.49 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  26.52 
 
 		 302 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  29.36 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  26.24 
 
 		 339 aa  103  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 357 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  29.29 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  28.04 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  25.57 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  34.85 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  29.18 
 
 		 357 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  27.99 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  26.65 
 
 		 337 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  29.93 
 
 		 347 aa  99.4  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  26.48 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  35.54 
 
 		 477 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  28.48 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  24.68 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  25.43 
 
 		 323 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  27.6 
 
 		 281 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  34.42 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  26.38 
 
 		 281 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  25.36 
 
 		 346 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  28.31 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  25.79 
 
 		 427 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  27.24 
 
 		 356 aa  96.7  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>