93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1068 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  44.84 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  42.14 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  42.95 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.71 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  43.06 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  40.6 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  41.49 
 
 		 283 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  36.84 
 
 		 304 aa  199  7e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  41.84 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  39.47 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  41.53 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  40.83 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  42.01 
 
 		 285 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  39.66 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  41.81 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  39.72 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  36.25 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  38.97 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  38.57 
 
 		 289 aa  175  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  40.28 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  39.22 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  36.49 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.75 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  41.7 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  32.99 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  34.93 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  39.93 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  37.12 
 
 		 254 aa  151  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  40.62 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  36.08 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  37.59 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  38.54 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  38.54 
 
 		 194 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  37.37 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  31.42 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  30.24 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  39.27 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.72 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  35.14 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.44 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  26.95 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  25.36 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.1 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  24.54 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  24.16 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  27.68 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  37.84 
 
 		 169 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.61 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.61 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.05 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  24.16 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  25.26 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.89 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  26.15 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  25.29 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  28.4 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  26.55 
 
 		 311 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  20.48 
 
 		 274 aa  46.2  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  23.01 
 
 		 299 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  23.01 
 
 		 299 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  26.38 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.32 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  23.61 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  27.43 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  24.66 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  24.66 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.14 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  23.72 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  25.27 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  24.66 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  28.26 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  26.69 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  22.12 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  24.44 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.24 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  24.22 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  27.11 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  24.07 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  23.37 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  25.3 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  24.44 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.34 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 365 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  25.81 
 
 		 426 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.28 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>