31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1005 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  872    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0989  hypothetical protein  38.17 
 
 		 433 aa  253  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  29.04 
 
 		 441 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3360  hypothetical protein  29.65 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  28.02 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  21.52 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  25.55 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1317  hypothetical protein  22.84 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.361107  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  30.94 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  23.3 
 
 		 461 aa  57  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  24.84 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  29.11 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  27.43 
 
 		 451 aa  50.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  31.82 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  29.36 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  27.78 
 
 		 339 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  22.03 
 
 		 460 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1106  hypothetical protein  24.86 
 
 		 372 aa  47  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0316487  hitchhiker  0.000249477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  22.03 
 
 		 460 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  31.33 
 
 		 584 aa  47  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  30.48 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  24.29 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  27.71 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  24.38 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  39.13 
 
 		 680 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  30.67 
 
 		 495 aa  44.3  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  42.37 
 
 		 707 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  29.47 
 
 		 461 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  23.16 
 
 		 408 aa  44.3  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  30.23 
 
 		 431 aa  43.5  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  32.43 
 
 		 378 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>