More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0979 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  535  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  68.22 
 
 		 276 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  64.91 
 
 		 270 aa  357  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  65.64 
 
 		 270 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  66.28 
 
 		 261 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  64.86 
 
 		 275 aa  351  7e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  63.18 
 
 		 264 aa  351  7e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  64.82 
 
 		 266 aa  350  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  67.44 
 
 		 272 aa  345  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0678  ABC transporter related  67.44 
 
 		 272 aa  345  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0646516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  67.44 
 
 		 272 aa  344  8e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0496  ABC transporter related  66.8 
 
 		 273 aa  341  9e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00107814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3954  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  67.05 
 
 		 272 aa  340  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  62.21 
 
 		 269 aa  339  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 		 269 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 		 269 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0692  ABC transporter related  65.89 
 
 		 277 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0722  ABC transporter related  65.89 
 
 		 277 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.165434 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3662  ABC transporter related  65.89 
 
 		 279 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392823  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0713  ABC transporter related  65.5 
 
 		 272 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0721  ABC transporter related  65.5 
 
 		 272 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  64.5 
 
 		 274 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  61.09 
 
 		 277 aa  334  7e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.48 
 
 		 269 aa  333  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  60.85 
 
 		 267 aa  332  3e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  63.18 
 
 		 294 aa  331  6e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  60.7 
 
 		 269 aa  331  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  64.64 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03186  putative transport protein (ABC superfamily, atp-binding)  65.22 
 
 		 266 aa  329  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3609  ABC transporter related  65 
 
 		 270 aa  327  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  60.77 
 
 		 269 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  61.39 
 
 		 283 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  59.62 
 
 		 265 aa  326  3e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  63.12 
 
 		 267 aa  326  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  59.92 
 
 		 270 aa  325  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  59.23 
 
 		 265 aa  323  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4360  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  63.08 
 
 		 271 aa  324  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132306  normal  0.0534611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  58.87 
 
 		 269 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  58.87 
 
 		 269 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3610  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  61.07 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  61.07 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3574  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  61.07 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3672  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  61.07 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0355723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  58.87 
 
 		 269 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3503  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  61.07 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4233  ABC transporter related  63.57 
 
 		 271 aa  322  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36582  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  58.87 
 
 		 269 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0505  toluene tolerance protein Ttg2A  64.73 
 
 		 268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0733  ABC transporter-related protein  61.89 
 
 		 267 aa  319  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.329181 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2102  ABC transporter, ATP-binding protein  63.12 
 
 		 267 aa  319  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0288  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.16 
 
 		 270 aa  318  6e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03060  predicted toluene transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  60.31 
 
 		 269 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0889868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0512  ABC transporter related protein  60.31 
 
 		 269 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.648269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3388  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  60.31 
 
 		 269 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0514753  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03011  hypothetical protein  60.31 
 
 		 269 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.086936  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3491  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  60.31 
 
 		 269 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3683  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  60.31 
 
 		 269 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00651992  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3575  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  60.31 
 
 		 269 aa  318  7.999999999999999e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4517  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  60.31 
 
 		 269 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257918  normal  0.710569 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  60.31 
 
 		 269 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.179528 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  59.62 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0281  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  61 
 
 		 270 aa  317  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3304  ABC transporter-related protein  62.07 
 
 		 292 aa  316  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3808  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  61.6 
 
 		 269 aa  316  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3631  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  60.31 
 
 		 270 aa  316  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1146  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  61.07 
 
 		 272 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0448  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  61.07 
 
 		 272 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.885469  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0512  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  61.07 
 
 		 272 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2120  ABC transporter related  61.78 
 
 		 274 aa  312  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0561  ABC transporter related  62.45 
 
 		 265 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  57.74 
 
 		 270 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3650  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  60.46 
 
 		 268 aa  310  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2887  ABC transporter ATP-binding protein  57.75 
 
 		 269 aa  308  5e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220334  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  56.03 
 
 		 274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  57.74 
 
 		 270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.03 
 
 		 276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  56.86 
 
 		 306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  54.79 
 
 		 286 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  54.79 
 
 		 286 aa  305  7e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  55.13 
 
 		 293 aa  304  8.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1190  ATP-binding ABC transporter protein  54.41 
 
 		 281 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  57.31 
 
 		 273 aa  301  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  55.68 
 
 		 277 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  55.68 
 
 		 277 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  55.98 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  55.85 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2962  ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 		 279 aa  297  9e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  55.13 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  56.32 
 
 		 278 aa  297  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  53.64 
 
 		 271 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  55.85 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  55.77 
 
 		 283 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  55.98 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  55.73 
 
 		 270 aa  295  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 272 aa  295  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  54.37 
 
 		 273 aa  295  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  54.75 
 
 		 273 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  54.75 
 
 		 273 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  54.75 
 
 		 273 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  54.92 
 
 		 283 aa  295  5e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>