More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0971 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  100 
 
 		 453 aa  902    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  46.99 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  47.12 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  45.78 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  46 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  45.56 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  45.43 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  45.78 
 
 		 454 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  45.91 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  45.91 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  46.99 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  45.91 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  46.35 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  52.02 
 
 		 452 aa  388  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  45.08 
 
 		 454 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  47.05 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  45.89 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  44.62 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  45.33 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  46.1 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  45.41 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  45.27 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  47.57 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  45.28 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  44.67 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  44.34 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  44.32 
 
 		 451 aa  372  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  44.76 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  45.39 
 
 		 453 aa  362  6e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  42.21 
 
 		 479 aa  358  9e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  43.45 
 
 		 481 aa  345  8e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  40.55 
 
 		 452 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  42.27 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  42.86 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  42.05 
 
 		 480 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  42.92 
 
 		 452 aa  342  9e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  41.82 
 
 		 480 aa  342  9e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  48.46 
 
 		 455 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  42.63 
 
 		 480 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  42.92 
 
 		 480 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  42.92 
 
 		 480 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  42.69 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  42.47 
 
 		 482 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  42.47 
 
 		 482 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  41.78 
 
 		 480 aa  333  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  41.61 
 
 		 481 aa  332  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  42.86 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  41.63 
 
 		 451 aa  323  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  42.63 
 
 		 480 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  38.41 
 
 		 475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  41.06 
 
 		 471 aa  310  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  37.16 
 
 		 492 aa  306  7e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  37.39 
 
 		 473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  42.49 
 
 		 478 aa  302  8.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  38.86 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  37.1 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  38.69 
 
 		 443 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  39.22 
 
 		 476 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  38.76 
 
 		 463 aa  293  4e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  39.95 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  39.86 
 
 		 471 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  38.41 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  38.8 
 
 		 492 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  37.27 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  38.37 
 
 		 492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  35.36 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  37.27 
 
 		 459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  37.47 
 
 		 491 aa  286  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  37.47 
 
 		 491 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  37.47 
 
 		 491 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  38.3 
 
 		 467 aa  286  5e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  38.07 
 
 		 467 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  38.22 
 
 		 473 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  38.06 
 
 		 473 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  38.32 
 
 		 477 aa  283  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  37.56 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  35.23 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  36.96 
 
 		 470 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  36.98 
 
 		 484 aa  277  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  37.79 
 
 		 481 aa  277  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  35.23 
 
 		 456 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  38.05 
 
 		 445 aa  276  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  35.6 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  35.23 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  35.27 
 
 		 445 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  39.86 
 
 		 471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  36.01 
 
 		 465 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  35.91 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  35.91 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  37.16 
 
 		 473 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  35.91 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  35.91 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  39.4 
 
 		 471 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  33.99 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  35.91 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  36.85 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  37.91 
 
 		 472 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  35.06 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  36.67 
 
 		 462 aa  267  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  35.54 
 
 		 454 aa  262  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>