More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0965 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  100 
 
 
290 aa  599  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0501  rhodanese domain-containing protein  32.45 
 
 
285 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  34.88 
 
 
270 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  32.64 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  32.96 
 
 
272 aa  145  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  30.51 
 
 
293 aa  138  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  30.51 
 
 
293 aa  138  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  31.4 
 
 
273 aa  138  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  31.32 
 
 
288 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  30.55 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  31.21 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  29.39 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  29.17 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  30.39 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  30.47 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  28.62 
 
 
285 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1807  Rhodanese domain protein  31.15 
 
 
264 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  29.03 
 
 
276 aa  123  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  28.47 
 
 
284 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  29.45 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1565  Rhodanese domain protein  32.83 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  29.56 
 
 
291 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  28.99 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.23 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  29.21 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  28.98 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  27.72 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  26.33 
 
 
647 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  29.11 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  27.56 
 
 
285 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  28.11 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  28.07 
 
 
285 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  28.27 
 
 
281 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  28.46 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  27.3 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  29.35 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 
281 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  30.45 
 
 
277 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  30.45 
 
 
277 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  30.53 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  27.05 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  26.39 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  29.13 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2096  Rhodanese domain protein  28.68 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  30.04 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  29.35 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  27.68 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  28.4 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  27.21 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  28.21 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  28.99 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.64 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 
293 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  29.04 
 
 
277 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  29.17 
 
 
279 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  27.08 
 
 
281 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  28.21 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  29.75 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  28.72 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  27.56 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  30.28 
 
 
277 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  30.28 
 
 
277 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  30.28 
 
 
277 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  31.18 
 
 
305 aa  113  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  27.02 
 
 
284 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  27.96 
 
 
301 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  29.51 
 
 
279 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  29.12 
 
 
289 aa  112  8.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  30.88 
 
 
276 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  28.31 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  28.31 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  28.47 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1422  rhodanese domain-containing protein  27.24 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  28.63 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  29.13 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  28.31 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  29.5 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  30.43 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  28.31 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  30 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  28.47 
 
 
477 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  28.77 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  29.13 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  30.84 
 
 
297 aa  110  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  30.86 
 
 
305 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.03 
 
 
280 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  26.97 
 
 
297 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  28.85 
 
 
613 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  29.96 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0689  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1954  Rhodanese domain protein  27.97 
 
 
335 aa  109  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.535428 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.76 
 
 
286 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  29.15 
 
 
295 aa  109  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  28.98 
 
 
277 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  28.78 
 
 
277 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  28.87 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>