More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0912 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 
112 aa  224  4e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  184  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  181  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  178  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  75.89 
 
 
112 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  179  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  74.11 
 
 
112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  177  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
136 aa  177  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  177  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  176  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  176  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  176  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  176  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  176  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
136 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  72.32 
 
 
112 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  176  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  176  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  176  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  176  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  176  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  72.32 
 
 
112 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  175  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  175  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  175  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  174  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  72.32 
 
 
112 aa  175  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  175  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  174  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  174  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  174  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  174  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
114 aa  171  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  71.43 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  69.64 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
121 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  170  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  170  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  171  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  170  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  69.64 
 
 
112 aa  170  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  169  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  71.43 
 
 
112 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  169  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  69.64 
 
 
112 aa  169  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  69.64 
 
 
112 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  72.32 
 
 
112 aa  168  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  168  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  168  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  167  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  167  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  167  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  72.32 
 
 
112 aa  166  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0833  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  166  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  166  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  166  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  166  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  166  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  166  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>