204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0900 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  29.75 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  31.89 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  32.67 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  32.67 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  32.67 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  32.67 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  32.67 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  31.89 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  32.67 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  31.75 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  31.89 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  40 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  30.92 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  33.49 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  32.68 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  32.68 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  31.84 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  31.84 
 
 		 279 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  32.68 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  39.32 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  39.32 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  32.68 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  28.16 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  27.27 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  30.47 
 
 		 269 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  27.98 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  27.8 
 
 		 254 aa  89.4  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  31.89 
 
 		 262 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  29.77 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  27.27 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  29.3 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  30.28 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  30.28 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  30.28 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  37.4 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  29.74 
 
 		 322 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  37.4 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  31.2 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  25.78 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  29.96 
 
 		 304 aa  86.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  28.38 
 
 		 322 aa  85.5  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  29.88 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  38.14 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  26.13 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  27.76 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  27.21 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  37.93 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2414  hypothetical protein  27.83 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  28.4 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  28.9 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  28.15 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  37.07 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  29.27 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  27.65 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  26.83 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  30.38 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  34.51 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  29.22 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.45 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.866947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  28 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  28.23 
 
 		 278 aa  72  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  33.63 
 
 		 283 aa  72  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  27.34 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  28.23 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  33.62 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  27.9 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  28.95 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  27.49 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  26.1 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  28.07 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  28.07 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  29.25 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  25.9 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  27.09 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  28.76 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  38.46 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  32.8 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  23.21 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  25.73 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  23.21 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  23.21 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>