More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0896 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0896  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238629  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.59 
 
 		 145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.95 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.5 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  43.05 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  41.38 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  44.16 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.19 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  43.51 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  43.51 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.51 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.07 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.14 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.23 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  39.04 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.03 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  43.06 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  40.14 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01608  hypothetical protein  39.72 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.52 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.56 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  39.01 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  39.73 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.06 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.21 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.21 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  40 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  40.28 
 
 		 146 aa  97.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  41.89 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.56 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  41.56 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  38.69 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  37.58 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  40.28 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  88.6  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  88.6  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  38.62 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  38.62 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  40 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.56 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  36.05 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  36.05 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  36.91 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  38.85 
 
 		 147 aa  87.4  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  38.85 
 
 		 147 aa  87.4  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.42 
 
 		 148 aa  87  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  35.71 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  35.71 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  35.71 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.46 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  35.71 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  35.71 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  35.71 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  35.71 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  36.91 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  35.76 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  36.91 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  37.58 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.44 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  36.73 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.73 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.73 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  31.97 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  39.55 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0793  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.55 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  32.24 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  34.72 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  33.33 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.67 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0771  protein TolR  33.77 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0802  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.77 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2585  protein TolR  33.77 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0319  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.77 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0761  protein TolR  36.17 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.156142  normal  0.243025 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.03 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.91 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2677  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.67 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  34.67 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.8 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0696  protein TolR  33.77 
 
 		 149 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.219875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0679  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.77 
 
 		 149 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  34.23 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  34.04 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  30.2 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3918  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.17 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833668  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2453  protein TolR  36.17 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.45 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.06 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.17 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  31.39 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  33.33 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  34.75 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  33.56 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.23 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0305  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.49 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  32.87 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>