More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0809 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  100 
 
 
397 aa  818    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.5 
 
 
397 aa  548  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  68.21 
 
 
393 aa  544  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  62.44 
 
 
404 aa  528  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  62.44 
 
 
404 aa  528  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.66 
 
 
396 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.46 
 
 
406 aa  522  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  64.14 
 
 
399 aa  518  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.4 
 
 
407 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  64.81 
 
 
392 aa  519  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.66 
 
 
403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.42 
 
 
403 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  64.57 
 
 
383 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  62.4 
 
 
397 aa  508  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.93 
 
 
403 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.1 
 
 
393 aa  503  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.66 
 
 
403 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.77 
 
 
396 aa  498  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.15 
 
 
403 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.57 
 
 
389 aa  501  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.91 
 
 
403 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.36 
 
 
402 aa  495  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.66 
 
 
403 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.15 
 
 
403 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.66 
 
 
403 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.26 
 
 
395 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.41 
 
 
403 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.68 
 
 
403 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.62 
 
 
394 aa  485  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.65 
 
 
394 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.67 
 
 
402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.16 
 
 
402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.02 
 
 
396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.42 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.32 
 
 
391 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.52 
 
 
410 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.93 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1608  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.76 
 
 
411 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.49 
 
 
402 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.18 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.18 
 
 
396 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.18 
 
 
396 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.76 
 
 
396 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.52 
 
 
410 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.27 
 
 
405 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.27 
 
 
423 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.02 
 
 
405 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.27 
 
 
423 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.27 
 
 
423 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.27 
 
 
396 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.27 
 
 
396 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.03 
 
 
404 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.27 
 
 
423 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.38 
 
 
401 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0792  cystathionine gamma-synthase  56.42 
 
 
424 aa  444  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.145563  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.5 
 
 
406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1689  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.18 
 
 
413 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.79324 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1730  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.53 
 
 
434 aa  444  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000563319  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.09 
 
 
407 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0798  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.72 
 
 
422 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.40297  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.57 
 
 
411 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.6 
 
 
404 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2225  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.35 
 
 
404 aa  428  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.833274  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  52.85 
 
 
396 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2150  cystathionine gamma-synthase  56.89 
 
 
414 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.73 
 
 
452 aa  408  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0722667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.79 
 
 
396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1236  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.22 
 
 
400 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1998  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.56 
 
 
409 aa  378  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.469724 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  46.08 
 
 
397 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  45.69 
 
 
388 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.95 
 
 
402 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.3 
 
 
402 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.38 
 
 
406 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1661  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.68 
 
 
394 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.39 
 
 
397 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.91 
 
 
408 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  46.39 
 
 
391 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.01 
 
 
403 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.45 
 
 
411 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0516  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.93 
 
 
412 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0538  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.67 
 
 
412 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0985823  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.23 
 
 
408 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0526  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.67 
 
 
412 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  44.7 
 
 
390 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.86 
 
 
407 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3860  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.31 
 
 
402 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.3 
 
 
398 aa  363  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.3 
 
 
401 aa  363  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.15 
 
 
406 aa  363  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  45.83 
 
 
392 aa  362  4e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3732  Cystathionine gamma-lyase  46.8 
 
 
393 aa  361  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3214  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.34 
 
 
413 aa  360  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.88 
 
 
422 aa  359  5e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.5 
 
 
397 aa  359  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.85 
 
 
394 aa  358  8e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  44.1 
 
 
402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10395  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.34 
 
 
406 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173886  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4904  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.5 
 
 
401 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.247924  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.18 
 
 
395 aa  354  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.168999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>