267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0794 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  456  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  59.72 
 
 		 215 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  57.27 
 
 		 216 aa  268  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  56.31 
 
 		 218 aa  268  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  58.14 
 
 		 210 aa  267  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  58.99 
 
 		 212 aa  266  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  58.06 
 
 		 211 aa  265  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  57.21 
 
 		 211 aa  265  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  56.68 
 
 		 210 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  54.84 
 
 		 210 aa  261  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  58.99 
 
 		 211 aa  260  8.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  55.3 
 
 		 210 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  55.3 
 
 		 210 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  55.3 
 
 		 210 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  55.3 
 
 		 210 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  55.3 
 
 		 210 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  55.3 
 
 		 210 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  58.06 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  54.84 
 
 		 210 aa  258  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  54.84 
 
 		 210 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  54.84 
 
 		 210 aa  258  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  54.84 
 
 		 210 aa  258  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  54.38 
 
 		 210 aa  258  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  56.68 
 
 		 210 aa  258  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  54.38 
 
 		 210 aa  257  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  54.38 
 
 		 210 aa  257  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  54.38 
 
 		 210 aa  257  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  58.06 
 
 		 211 aa  257  9e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  54.84 
 
 		 210 aa  257  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  54.38 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  56.22 
 
 		 210 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  55.3 
 
 		 211 aa  255  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  53.92 
 
 		 212 aa  254  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  55.3 
 
 		 210 aa  254  8e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  53 
 
 		 210 aa  254  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  56.22 
 
 		 209 aa  254  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  53.46 
 
 		 211 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  53.46 
 
 		 212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  52.07 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6747  radical SAM domain-containing protein  55.76 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  53.92 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  52.53 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  57.6 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  53.92 
 
 		 211 aa  251  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  54.59 
 
 		 212 aa  250  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  53.92 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  54.59 
 
 		 212 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4381  hypothetical protein  53.56 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  53.46 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  54.13 
 
 		 212 aa  244  6e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  52.97 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3190  hypothetical protein  54.84 
 
 		 211 aa  242  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241224  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  52.97 
 
 		 212 aa  242  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  53.7 
 
 		 210 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1410  radical SAM domain protein  54.88 
 
 		 211 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  50.69 
 
 		 210 aa  238  6.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1161  Radical SAM domain protein  54.38 
 
 		 210 aa  235  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0597  hypothetical protein  52.53 
 
 		 216 aa  234  8e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  53.92 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  53 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  49.77 
 
 		 217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2298  hypothetical protein  52.07 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6594  radical SAM domain-containing protein  55.76 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  52.47 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1115  radical SAM domain-containing protein  53 
 
 		 209 aa  224  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1081  hypothetical protein  54.13 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  53.51 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  38.11 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  37.23 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  31.84 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  32.13 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  31.08 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  27.27 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  30.45 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  29.6 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  29.68 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  29.88 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  30.33 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  31.56 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  28.77 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  29.77 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  29.28 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  29.84 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  27.5 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  30.4 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  29.32 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  27.71 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  36.43 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  28.16 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  26.36 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>