More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0774 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 589 aa  1226    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  47.28 
 
 		 598 aa  540  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  44.12 
 
 		 585 aa  525  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  46.88 
 
 		 596 aa  525  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  43.6 
 
 		 584 aa  519  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  43.94 
 
 		 587 aa  511  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  45.08 
 
 		 577 aa  511  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  42.53 
 
 		 578 aa  505  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  42.53 
 
 		 578 aa  505  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  42.53 
 
 		 578 aa  505  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  42.23 
 
 		 581 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  41.18 
 
 		 586 aa  484  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  42.42 
 
 		 544 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  42.28 
 
 		 561 aa  464  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  39.4 
 
 		 591 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  43.31 
 
 		 568 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  44.33 
 
 		 556 aa  444  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  39.72 
 
 		 559 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  39.4 
 
 		 559 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  39.4 
 
 		 559 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  39.51 
 
 		 555 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  39.4 
 
 		 559 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  39.4 
 
 		 559 aa  431  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  39.58 
 
 		 559 aa  432  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  38.78 
 
 		 565 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  35.05 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  36.38 
 
 		 583 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  36.96 
 
 		 586 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  36.23 
 
 		 583 aa  360  4e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  36.05 
 
 		 586 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  33.74 
 
 		 589 aa  349  8e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  34.32 
 
 		 586 aa  342  9e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  33.87 
 
 		 575 aa  341  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  34.89 
 
 		 575 aa  333  7.000000000000001e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  31.03 
 
 		 489 aa  187  4e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  31.52 
 
 		 485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  29.79 
 
 		 493 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  30.74 
 
 		 492 aa  180  4.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  28.79 
 
 		 491 aa  180  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  27.69 
 
 		 482 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  28.08 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  30.26 
 
 		 498 aa  167  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  29.63 
 
 		 493 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  27.74 
 
 		 508 aa  160  7e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  29.03 
 
 		 494 aa  158  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  29.09 
 
 		 492 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  28.82 
 
 		 494 aa  157  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  28.82 
 
 		 494 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  28.88 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  29.53 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  28.88 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  25.99 
 
 		 645 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  25.09 
 
 		 650 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  26.17 
 
 		 649 aa  144  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  23.85 
 
 		 663 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  24.66 
 
 		 650 aa  141  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  25.9 
 
 		 646 aa  139  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  24.72 
 
 		 652 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  23.44 
 
 		 650 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  23.44 
 
 		 644 aa  134  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  24.78 
 
 		 534 aa  133  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  30.51 
 
 		 1092 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  23.64 
 
 		 667 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  31.25 
 
 		 1088 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  31.25 
 
 		 1088 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  31.25 
 
 		 1088 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  28.52 
 
 		 548 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  24.45 
 
 		 651 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  22.56 
 
 		 650 aa  130  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  23.13 
 
 		 636 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  30.51 
 
 		 1088 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  30.32 
 
 		 1085 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  23.94 
 
 		 639 aa  128  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  29.7 
 
 		 551 aa  128  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 		 643 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  23.77 
 
 		 641 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  25.3 
 
 		 638 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  30.15 
 
 		 1101 aa  127  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  24.07 
 
 		 551 aa  127  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  30.29 
 
 		 1088 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  30.43 
 
 		 1094 aa  125  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  30.29 
 
 		 1164 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  30.29 
 
 		 1164 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  31.27 
 
 		 1100 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  31.05 
 
 		 1088 aa  124  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  28.15 
 
 		 558 aa  124  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  29.58 
 
 		 1100 aa  123  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  30.15 
 
 		 1142 aa  123  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  30.15 
 
 		 1112 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  23.61 
 
 		 672 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  29.78 
 
 		 572 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  25.72 
 
 		 638 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  29.78 
 
 		 553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  29.52 
 
 		 1111 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  28.39 
 
 		 1098 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  32.24 
 
 		 1154 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  29.15 
 
 		 1112 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  28.41 
 
 		 1115 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  29.3 
 
 		 1100 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  29.3 
 
 		 1099 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>