More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0750 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 650 aa  1303    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  50.35 
 
 		 723 aa  626  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  48.85 
 
 		 741 aa  615  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  48.04 
 
 		 767 aa  617  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  48.44 
 
 		 733 aa  617  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  48.33 
 
 		 751 aa  615  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  51.04 
 
 		 709 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  50.78 
 
 		 719 aa  608  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  48.79 
 
 		 746 aa  610  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 		 747 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  47.44 
 
 		 754 aa  600  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  47.52 
 
 		 760 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  48.24 
 
 		 714 aa  595  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  47.58 
 
 		 747 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  47.56 
 
 		 733 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  46.83 
 
 		 759 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  47.96 
 
 		 758 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  46 
 
 		 734 aa  581  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  47.13 
 
 		 715 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  56.78 
 
 		 745 aa  525  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  53.97 
 
 		 744 aa  510  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  52.93 
 
 		 736 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  54.67 
 
 		 739 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  55.1 
 
 		 743 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  64.03 
 
 		 747 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  54.3 
 
 		 737 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  63.78 
 
 		 747 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  52.31 
 
 		 748 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  50.98 
 
 		 738 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  54.12 
 
 		 748 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  54.25 
 
 		 744 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  50.44 
 
 		 746 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  63.38 
 
 		 754 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  49.57 
 
 		 741 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  52.45 
 
 		 753 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  62.89 
 
 		 758 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  51.06 
 
 		 785 aa  488  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 		 614 aa  482  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  48.98 
 
 		 762 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  49.15 
 
 		 762 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  52.17 
 
 		 734 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  42.09 
 
 		 769 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  41.36 
 
 		 769 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  59.85 
 
 		 739 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  41.36 
 
 		 769 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  41.24 
 
 		 770 aa  464  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  39.56 
 
 		 803 aa  463  1e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  40.62 
 
 		 774 aa  458  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  41.01 
 
 		 770 aa  456  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 687 aa  449  1e-125  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  40.03 
 
 		 785 aa  442  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.89 
 
 		 639 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 652 aa  418  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 604 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 691 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 681 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  35.07 
 
 		 801 aa  385  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  54.23 
 
 		 552 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  54.23 
 
 		 552 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 		 696 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  36.05 
 
 		 685 aa  379  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 796 aa  378  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 695 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  46.44 
 
 		 783 aa  379  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 		 770 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 697 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  35.67 
 
 		 720 aa  372  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 878 aa  372  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 694 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 652 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 702 aa  364  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 673 aa  365  2e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 701 aa  365  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  35.11 
 
 		 928 aa  361  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  32.85 
 
 		 692 aa  361  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  35.86 
 
 		 888 aa  359  8e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 598 aa  359  8e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  45.61 
 
 		 603 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 671 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 660 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  34.85 
 
 		 922 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 		 702 aa  356  7.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  34.91 
 
 		 934 aa  356  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 666 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  40.53 
 
 		 610 aa  352  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 654 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 		 607 aa  352  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  35.8 
 
 		 654 aa  351  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  33.82 
 
 		 707 aa  350  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 654 aa  350  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  35.95 
 
 		 654 aa  349  9e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  35.8 
 
 		 654 aa  349  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  33.85 
 
 		 715 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  35.8 
 
 		 654 aa  348  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  35.8 
 
 		 652 aa  348  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  35.65 
 
 		 652 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  44.47 
 
 		 606 aa  348  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  35.8 
 
 		 654 aa  348  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  33.58 
 
 		 660 aa  348  2e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  43.26 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>