More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0641 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  54.86 
 
 		 568 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  100 
 
 		 560 aa  1135    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  54.59 
 
 		 565 aa  628  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  55.15 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  53.57 
 
 		 563 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  47.94 
 
 		 571 aa  529  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  45.65 
 
 		 688 aa  511  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  42.17 
 
 		 558 aa  450  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  41.83 
 
 		 871 aa  441  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  39.79 
 
 		 787 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  39.35 
 
 		 562 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  39.17 
 
 		 563 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  39.78 
 
 		 564 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  41.67 
 
 		 553 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  39.6 
 
 		 555 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  38.71 
 
 		 554 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  39.49 
 
 		 553 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  39.57 
 
 		 557 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.86 
 
 		 570 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  37.57 
 
 		 567 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  40.78 
 
 		 612 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.2 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  38.23 
 
 		 577 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  39.28 
 
 		 553 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.92 
 
 		 558 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  40.22 
 
 		 568 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  37.14 
 
 		 564 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  38.1 
 
 		 573 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.68 
 
 		 568 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  40.24 
 
 		 573 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.68 
 
 		 568 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  39.18 
 
 		 571 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40 
 
 		 568 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  38.43 
 
 		 561 aa  395  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  36.4 
 
 		 568 aa  393  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  38.31 
 
 		 557 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  39.18 
 
 		 558 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  38.9 
 
 		 637 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  38.97 
 
 		 561 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  39.53 
 
 		 565 aa  393  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  39.2 
 
 		 574 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.43 
 
 		 563 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  38.42 
 
 		 570 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  37.81 
 
 		 571 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.1 
 
 		 571 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  37.81 
 
 		 561 aa  389  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.68 
 
 		 568 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.32 
 
 		 568 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  40 
 
 		 586 aa  388  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  38.53 
 
 		 568 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  38.46 
 
 		 589 aa  388  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  37.66 
 
 		 561 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  36.54 
 
 		 577 aa  383  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  39.5 
 
 		 594 aa  385  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  38.1 
 
 		 566 aa  385  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  38.86 
 
 		 568 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  38.74 
 
 		 586 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.68 
 
 		 568 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  39.11 
 
 		 561 aa  385  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  38.84 
 
 		 574 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  38.36 
 
 		 563 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  37.5 
 
 		 603 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  37.61 
 
 		 578 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  37.91 
 
 		 577 aa  382  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.3 
 
 		 556 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  38.28 
 
 		 570 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  37.1 
 
 		 575 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  37.85 
 
 		 569 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  38.88 
 
 		 559 aa  376  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  38.43 
 
 		 599 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  37.4 
 
 		 668 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  39 
 
 		 582 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.5 
 
 		 568 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.61 
 
 		 568 aa  379  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  38.21 
 
 		 586 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  37.7 
 
 		 587 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  38.21 
 
 		 586 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  38.21 
 
 		 586 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  38.21 
 
 		 586 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  38.21 
 
 		 586 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  38.15 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  38.21 
 
 		 586 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  38.12 
 
 		 585 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.61 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  38.43 
 
 		 599 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  39.17 
 
 		 554 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  38.21 
 
 		 586 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  37.75 
 
 		 577 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  37.86 
 
 		 586 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  37.1 
 
 		 591 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  38.43 
 
 		 599 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  39.53 
 
 		 585 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  37.81 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  35.4 
 
 		 670 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1610  type II secretion system protein E  35.57 
 
 		 673 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  40.33 
 
 		 520 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  36.95 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2141  type II secretion system protein E  37.61 
 
 		 569 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000466372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  37.86 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  38.43 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>