More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0611 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  65.3 
 
 		 513 aa  660    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  65.11 
 
 		 513 aa  660    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  70.65 
 
 		 514 aa  755    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  65.11 
 
 		 513 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0815  2-isopropylmalate synthase  60.71 
 
 		 515 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2176  2-isopropylmalate synthase  64.65 
 
 		 514 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  67.7 
 
 		 513 aa  726    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  70.06 
 
 		 516 aa  731    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  63.94 
 
 		 513 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  65.75 
 
 		 511 aa  689    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  65.94 
 
 		 512 aa  676    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  65.3 
 
 		 515 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  69.67 
 
 		 511 aa  745    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  64.06 
 
 		 514 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  64.02 
 
 		 513 aa  657    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  62.95 
 
 		 512 aa  661    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 514 aa  1053    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  64.26 
 
 		 516 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  64.65 
 
 		 514 aa  684    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  68.04 
 
 		 513 aa  681    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  70.65 
 
 		 510 aa  745    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  65.3 
 
 		 515 aa  671    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  64.34 
 
 		 512 aa  663    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  67.97 
 
 		 515 aa  691    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  66.47 
 
 		 515 aa  692    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  62.15 
 
 		 513 aa  653    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  64.06 
 
 		 515 aa  678    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  65.3 
 
 		 515 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  64.34 
 
 		 512 aa  665    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  64.72 
 
 		 513 aa  667    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  64.26 
 
 		 515 aa  680    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  64.65 
 
 		 514 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  68.04 
 
 		 513 aa  681    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  66.27 
 
 		 527 aa  698    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  73.1 
 
 		 517 aa  763    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1018  2-isopropylmalate synthase  64.26 
 
 		 514 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2298  2-isopropylmalate synthase  64.65 
 
 		 514 aa  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  65.3 
 
 		 515 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  69.94 
 
 		 515 aa  724    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  64.65 
 
 		 514 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  63.22 
 
 		 513 aa  646    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  72.1 
 
 		 516 aa  758    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  63.15 
 
 		 512 aa  658    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  63.55 
 
 		 512 aa  663    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  66.14 
 
 		 512 aa  677    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3626  2-isopropylmalate synthase  62.75 
 
 		 512 aa  647    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  74.07 
 
 		 516 aa  776    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  70.98 
 
 		 516 aa  748    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  66.93 
 
 		 511 aa  709    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1058  2-isopropylmalate synthase  60.91 
 
 		 515 aa  632  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  57.65 
 
 		 524 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  61.04 
 
 		 513 aa  583  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  58.46 
 
 		 513 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  55.38 
 
 		 524 aa  569  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  55.75 
 
 		 527 aa  568  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  56.01 
 
 		 524 aa  561  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  57.66 
 
 		 512 aa  561  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  56.05 
 
 		 514 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  54.31 
 
 		 520 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  57.65 
 
 		 516 aa  561  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  55.01 
 
 		 520 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  54.12 
 
 		 520 aa  558  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  55.49 
 
 		 523 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  54.22 
 
 		 521 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  53.73 
 
 		 520 aa  557  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  55.12 
 
 		 532 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  55.01 
 
 		 519 aa  554  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  55.67 
 
 		 509 aa  552  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  54.88 
 
 		 529 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  55.86 
 
 		 525 aa  550  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  54.6 
 
 		 526 aa  549  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  54.29 
 
 		 524 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  53.91 
 
 		 529 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  55.38 
 
 		 507 aa  548  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  54.1 
 
 		 529 aa  548  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  55.69 
 
 		 527 aa  548  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  55.38 
 
 		 507 aa  547  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  56.05 
 
 		 519 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  53.89 
 
 		 524 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  53.33 
 
 		 521 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  53.89 
 
 		 524 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  56.65 
 
 		 512 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  52.25 
 
 		 520 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  54.84 
 
 		 518 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  54.67 
 
 		 520 aa  537  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0491  2-isopropylmalate synthase  54.96 
 
 		 504 aa  536  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  54.58 
 
 		 508 aa  537  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  55.06 
 
 		 536 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  55.03 
 
 		 517 aa  537  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  54.31 
 
 		 509 aa  536  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  54.76 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  55.06 
 
 		 536 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  53.49 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  53.29 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  54.56 
 
 		 541 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  54.56 
 
 		 504 aa  532  1e-150  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  55.47 
 
 		 525 aa  533  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  55.4 
 
 		 503 aa  531  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  54.49 
 
 		 536 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  55.33 
 
 		 516 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>