More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0598 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0598  N-acetylglutamate synthase  100 
 
 		 453 aa  926    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00244264  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04920  N-acetylglutamate synthase  42.69 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0324  N-acetylglutamate synthase  41.2 
 
 		 448 aa  326  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5185  N-acetylglutamate synthase  41.3 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5949  N-acetylglutamate synthase  40.6 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0354  N-acetylglutamate synthase  41.76 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5092  N-acetylglutamate synthase  41.3 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68740  N-acetylglutamate synthase  40.6 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0254  N-acetylglutamate synthase  42.46 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1103  N-acetylglutamate synthase  41.01 
 
 		 440 aa  323  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.540979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5245  N-acetylglutamate synthase  41.07 
 
 		 432 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.987249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0278  N-acetylglutamate synthase  41.3 
 
 		 432 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0664  N-acetylglutamate synthase  40.87 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0813  N-acetylglutamate synthase  40.87 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0360  N-acetylglutamate synthase  40.42 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  39.12 
 
 		 435 aa  316  6e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0572  N-acetylglutamate synthase  39.14 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0465  N-acetylglutamate synthase  38.44 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.135467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5419  N-acetylglutamate synthase  41.07 
 
 		 432 aa  309  8e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0154  N-acetylglutamate synthase  40.18 
 
 		 442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2252  XRE family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000906633  unclonable  0.000000183294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0977  N-acetylglutamate synthase  39.67 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2250  N-acetylglutamate synthase  39.53 
 
 		 440 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2066  N-acetylglutamate synthase  39.21 
 
 		 477 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216561  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2405  N-acetylglutamate synthase  39.36 
 
 		 440 aa  302  8.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2089  N-acetylglutamate synthase  39.13 
 
 		 440 aa  300  4e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2084  N-acetylglutamate synthase  37.35 
 
 		 448 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.212235  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3825  N-acetylglutamate synthase  39.27 
 
 		 439 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2070  N-acetylglutamate synthase  38.05 
 
 		 478 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4573  N-acetylglutamate synthase  37.41 
 
 		 448 aa  296  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0329  N-acetylglutamate synthase  38.36 
 
 		 439 aa  296  7e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.758778  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1170  N-acetylglutamate synthase  38.52 
 
 		 465 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2013  N-acetylglutamate synthase  39.72 
 
 		 460 aa  295  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0330  N-acetylglutamate synthase  38.81 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000023217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2295  amino-acid N-acetyltransferase  38.79 
 
 		 456 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0223326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4245  N-acetylglutamate synthase  38.95 
 
 		 445 aa  293  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0919  N-acetylglutamate synthase  37.33 
 
 		 441 aa  293  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3834  N-acetylglutamate synthase  38.81 
 
 		 440 aa  293  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00527  N-acetylglutamate synthase  38.3 
 
 		 436 aa  292  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1115  N-acetylglutamate synthase  39.44 
 
 		 459 aa  292  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383123  normal  0.718299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1344  amino-acid N-acetyltransferase  37.38 
 
 		 440 aa  292  8e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.18548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3594  N-acetylglutamate synthase  38.72 
 
 		 445 aa  292  8e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40133  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1250  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 		 451 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2066  N-acetylglutamate synthase  39.21 
 
 		 459 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3385  N-acetylglutamate synthase  36.88 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0380  N-acetylglutamate synthase  39.06 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2174  N-acetylglutamate synthase  39.21 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5921  N-acetylglutamate synthase  39.21 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0362  N-acetylglutamate synthase  38.72 
 
 		 445 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2156  N-acetylglutamate synthase  39.21 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.67226  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03295  N-acetylglutamate synthase  38.62 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0993  N-acetylglutamate synthase  37.78 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1489  N-acetylglutamate synthase  38.52 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00249644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1045  N-acetylglutamate synthase  37.78 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3229  N-acetylglutamate synthase  37.78 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.781275 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2327  N-acetylglutamate synthase  36.51 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3767  N-acetylglutamate synthase  38.27 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.078519  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5465  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 		 459 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1530  N-acetylglutamate synthase  36.28 
 
 		 448 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1078  N-acetylglutamate synthase  38.05 
 
 		 465 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0388  N-acetylglutamate synthase  38.24 
 
 		 439 aa  289  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0404545  hitchhiker  0.000000193555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2193  N-acetylglutamate synthase  38.52 
 
 		 459 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0379  N-acetylglutamate synthase  38.43 
 
 		 439 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0107482  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0380  N-acetylglutamate synthase  38.43 
 
 		 439 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000181036  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0405  N-acetylglutamate synthase  38.43 
 
 		 439 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104668  hitchhiker  0.00000000018898 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0391  N-acetylglutamate synthase  38.43 
 
 		 439 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00634801  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3138  N-acetylglutamate synthase  37.33 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3189  N-acetylglutamate synthase  37.1 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0533084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1751  N-acetylglutamate synthase  38.28 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2777  N-acetylglutamate synthase  38.28 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0465  N-acetylglutamate synthase  38.2 
 
 		 439 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000881657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2965  N-acetylglutamate synthase  38.01 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.80689 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2260  N-acetylglutamate synthase  38.28 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2643  N-acetylglutamate synthase  38.28 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2699  N-acetylglutamate synthase  38.28 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1532  N-acetylglutamate synthase  38.28 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.392031  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3059  N-acetylglutamate synthase  38.28 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265876  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3155  N-acetylglutamate synthase  37.33 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3044  N-acetylglutamate synthase  37.78 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02666  N-acetylglutamate synthase  37.78 
 
 		 443 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.939553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0873  amino-acid N-acetyltransferase  37.78 
 
 		 443 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2964  N-acetylglutamate synthase  37.78 
 
 		 443 aa  286  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0872  N-acetylglutamate synthase  39.35 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3318  N-acetylglutamate synthase  37.1 
 
 		 443 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0897  N-acetylglutamate synthase  37.78 
 
 		 443 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.763096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1837  N-acetylglutamate synthase  38.52 
 
 		 458 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148151  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3218  N-acetylglutamate synthase  37.1 
 
 		 443 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3138  N-acetylglutamate synthase  37.78 
 
 		 443 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02627  hypothetical protein  37.78 
 
 		 443 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3204  N-acetylglutamate synthase  37.1 
 
 		 443 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2046  N-acetylglutamate synthase  36.94 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.398173  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3005  N-acetylglutamate synthase  37.56 
 
 		 441 aa  286  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002688  N-acetylglutamate synthase  38.16 
 
 		 445 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4083  N-acetylglutamate synthase  37.56 
 
 		 443 aa  286  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3261  N-acetylglutamate synthase  37.39 
 
 		 443 aa  286  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4558  N-acetylglutamate synthase  37.9 
 
 		 439 aa  285  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108665  hitchhiker  0.0000557237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3812  N-acetylglutamate synthase  36.3 
 
 		 441 aa  286  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119295  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1522  N-acetylglutamate synthase  37.13 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1262  N-acetylglutamate synthase  36.96 
 
 		 454 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0481247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2105  N-acetylglutamate synthase  35.37 
 
 		 451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>