More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0576 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  528  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  52.94 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  52.92 
 
 		 257 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  52.52 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  52.52 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  51.91 
 
 		 262 aa  258  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  50.61 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  52.12 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  49.8 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  52.32 
 
 		 269 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  49.39 
 
 		 252 aa  255  6e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  49.79 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  49.79 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  49.79 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  51.49 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  51.26 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  49.8 
 
 		 252 aa  252  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  49.58 
 
 		 257 aa  251  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  48.15 
 
 		 252 aa  248  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  48.55 
 
 		 265 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  47.33 
 
 		 276 aa  242  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  48.95 
 
 		 260 aa  241  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  46.09 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  46.09 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  46.09 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  46.09 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  45.16 
 
 		 268 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 251 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  46.09 
 
 		 251 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  46.09 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  45.68 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  46.09 
 
 		 251 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  46.09 
 
 		 251 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  46.09 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  46.09 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  48.76 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  46.09 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  46.09 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  49.59 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  45.38 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  44.3 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  46.09 
 
 		 261 aa  225  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  44.18 
 
 		 298 aa  225  7e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 		 298 aa  224  9e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  47.68 
 
 		 264 aa  222  6e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  43.04 
 
 		 243 aa  221  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  41.34 
 
 		 304 aa  221  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  43.04 
 
 		 243 aa  221  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  46.47 
 
 		 262 aa  221  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  42 
 
 		 303 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  42.17 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  43.25 
 
 		 301 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  45.64 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  42.11 
 
 		 243 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  40.79 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  44.8 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  39.58 
 
 		 256 aa  205  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  41.73 
 
 		 243 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  42.13 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  39.39 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  44.92 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  45.61 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  41.67 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  39.75 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  42.44 
 
 		 275 aa  192  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.16 
 
 		 242 aa  161  9e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  32.74 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  34.11 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  33.33 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  34.44 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  34.27 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  31.92 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4569  ABC transporter-like protein protein  33.21 
 
 		 267 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  31.76 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  32.87 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  32.87 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  35.09 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  32.05 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  33.33 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  31.27 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  31.27 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  35.35 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  29.2 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  31.91 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  33.18 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.6 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  28.79 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  35.06 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  31.87 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  30.97 
 
 		 239 aa  136  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  31.66 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  31.42 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  31.73 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  33.97 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  32.88 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.63 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>