267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0573 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 175 aa  366  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  48.45 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 163 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  51.23 
 
 		 165 aa  170  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  51.83 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  51.53 
 
 		 160 aa  168  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  47.17 
 
 		 163 aa  167  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  50.94 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 159 aa  165  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 160 aa  164  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  51.2 
 
 		 167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 171 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 161 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 160 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 160 aa  162  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  53.62 
 
 		 160 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 160 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  45.24 
 
 		 170 aa  161  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  53.62 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  44.87 
 
 		 162 aa  160  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  44.87 
 
 		 162 aa  160  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  44.87 
 
 		 162 aa  160  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  44.87 
 
 		 162 aa  160  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  44.87 
 
 		 162 aa  160  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  44.87 
 
 		 162 aa  160  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  44.87 
 
 		 162 aa  160  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  46.99 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  52.9 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  46.91 
 
 		 161 aa  159  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 160 aa  158  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  44.87 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 171 aa  157  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 		 165 aa  157  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 159 aa  157  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 159 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 159 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  43.11 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 159 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 159 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  46.25 
 
 		 159 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 160 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 		 159 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  53.19 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  43.21 
 
 		 165 aa  154  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  45.28 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 188 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0559  dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  43.27 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  42.86 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  47.5 
 
 		 163 aa  147  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  45.61 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1503  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  41.98 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  43.11 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  41.98 
 
 		 167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  41.98 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  43.21 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  41.92 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  39.26 
 
 		 167 aa  141  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  39.26 
 
 		 167 aa  141  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  41.14 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>