More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0533 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  100 
 
 
394 aa  812    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  57.73 
 
 
392 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  58.12 
 
 
391 aa  478  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.7 
 
 
398 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.92 
 
 
399 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  54.92 
 
 
390 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  55.27 
 
 
392 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  56.74 
 
 
394 aa  454  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  53.77 
 
 
389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.51 
 
 
410 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  53.51 
 
 
389 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.24 
 
 
393 aa  448  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  54.78 
 
 
388 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  53.11 
 
 
390 aa  438  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  52.21 
 
 
391 aa  434  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.21 
 
 
412 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  51.8 
 
 
398 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  53.08 
 
 
394 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  50.38 
 
 
402 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  50.26 
 
 
402 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  48.97 
 
 
404 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.26 
 
 
388 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  53.26 
 
 
388 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  52.32 
 
 
410 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  53.05 
 
 
395 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  48.71 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  48.59 
 
 
404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  48.71 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  47.95 
 
 
404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  49.49 
 
 
396 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  48.2 
 
 
398 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  47.7 
 
 
400 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  51.45 
 
 
400 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  50.51 
 
 
400 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.78 
 
 
397 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0727  acetylornithine aminotransferase  51.31 
 
 
389 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1405  acetylornithine aminotransferase  47.31 
 
 
393 aa  374  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.966648  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1057  acetylornithine aminotransferase  46.8 
 
 
393 aa  371  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148742  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  46.25 
 
 
395 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  45.88 
 
 
402 aa  368  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  48.03 
 
 
396 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  45.01 
 
 
397 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  45.45 
 
 
396 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  44.5 
 
 
397 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1423  acetylornithine aminotransferase  45.78 
 
 
398 aa  363  3e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.050105  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  44.33 
 
 
395 aa  363  4e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.88 
 
 
399 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  45.22 
 
 
394 aa  361  1e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  45.22 
 
 
403 aa  361  1e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  47.18 
 
 
394 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  47.66 
 
 
391 aa  361  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  44.13 
 
 
399 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  44.76 
 
 
396 aa  361  2e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  44.59 
 
 
395 aa  358  7e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  44.47 
 
 
418 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  44.59 
 
 
399 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  44.22 
 
 
418 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  44.99 
 
 
426 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  45.9 
 
 
396 aa  351  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  46.49 
 
 
385 aa  350  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  45.71 
 
 
385 aa  350  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.39 
 
 
400 aa  349  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  44.22 
 
 
399 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  45.36 
 
 
418 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.29 
 
 
413 aa  344  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  43.04 
 
 
398 aa  343  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  46.03 
 
 
396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.33 
 
 
387 aa  343  4e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  46.08 
 
 
400 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.15 
 
 
417 aa  340  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  45.29 
 
 
386 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  42.44 
 
 
390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  43.94 
 
 
423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  44.74 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  45.19 
 
 
422 aa  335  9e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.24 
 
 
397 aa  335  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  43.92 
 
 
398 aa  333  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.65 
 
 
402 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  44.22 
 
 
400 aa  333  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.56 
 
 
399 aa  332  9e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  44.11 
 
 
427 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  43.88 
 
 
444 aa  332  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  43.26 
 
 
397 aa  331  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.18 
 
 
397 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.28 
 
 
427 aa  331  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  44.04 
 
 
405 aa  330  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  42.01 
 
 
398 aa  330  4e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  42.89 
 
 
401 aa  329  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.38 
 
 
387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  44.71 
 
 
396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14621  acetylornithine aminotransferase  43.15 
 
 
417 aa  325  6e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  43.04 
 
 
395 aa  325  7e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  42.04 
 
 
397 aa  325  7e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.92 
 
 
396 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.97 
 
 
395 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  44.59 
 
 
395 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0638  acetylornithine aminotransferase  41.75 
 
 
397 aa  323  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15001  acetylornithine aminotransferase  43.11 
 
 
391 aa  323  5e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1397  acetylornithine aminotransferase  43.26 
 
 
417 aa  322  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  42.82 
 
 
403 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>