More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0503 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 311 aa  642    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  57.64 
 
 		 315 aa  368  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  57.64 
 
 		 315 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  57.32 
 
 		 315 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  57.81 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1362  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  57.84 
 
 		 333 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5916  KpsF/GutQ family protein  58.48 
 
 		 310 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3211  KpsF/GutQ family sugar isomerase  56.21 
 
 		 311 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3249  KpsF/GutQ family sugar isomerase  56.21 
 
 		 311 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3262  arabinose-5-phosphate isomerase  56.21 
 
 		 351 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  54.46 
 
 		 318 aa  347  1e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6257  KpsF/GutQ family protein  55.88 
 
 		 311 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6185  KpsF/GutQ family protein  60.15 
 
 		 291 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5735  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.9 
 
 		 320 aa  330  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  55.26 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  53.92 
 
 		 342 aa  324  9e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  54.49 
 
 		 310 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  51.29 
 
 		 321 aa  321  9.999999999999999e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  53.85 
 
 		 310 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  53.18 
 
 		 317 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0617  KpsF/GutQ family protein  49.01 
 
 		 319 aa  295  8e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.851934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  49.84 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  49.04 
 
 		 322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  48.71 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  47.13 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  48.72 
 
 		 322 aa  285  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  47.91 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  47.91 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  48.54 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  48.54 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 		 331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  48.09 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.33 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  49.03 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  48.38 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  47.59 
 
 		 321 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  47.74 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  48.88 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  47.45 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  50.8 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  47.9 
 
 		 326 aa  279  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  47.45 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.28 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  47.12 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  45.66 
 
 		 339 aa  278  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  48.87 
 
 		 329 aa  278  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 		 363 aa  278  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  45.66 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  45.66 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  47.45 
 
 		 324 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.58 
 
 		 345 aa  277  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  48.88 
 
 		 346 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.08 
 
 		 357 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.08 
 
 		 342 aa  276  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  48.72 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.08 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  46.82 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  46.91 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  46.91 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  46.45 
 
 		 339 aa  275  7e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  47.44 
 
 		 330 aa  275  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 		 328 aa  275  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  45.83 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  47.63 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  46.6 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  46.5 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  48.08 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  47.76 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  46.82 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  46.28 
 
 		 324 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  47.42 
 
 		 321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  48.72 
 
 		 333 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  48.24 
 
 		 327 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  46.67 
 
 		 319 aa  271  9e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.43 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.43 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.43 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  49.03 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  46.6 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.43 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12348  Sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  45.63 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  45.95 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  47.12 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0776  KpsF/GutQ family protein  45.95 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  48.05 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.24 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  46.67 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.1 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  46.98 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.24 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>