252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0410 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  67.6 
 
 		 180 aa  270  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 204 aa  265  4e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.72 
 
 		 182 aa  264  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.16 
 
 		 182 aa  263  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.04 
 
 		 181 aa  263  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.6 
 
 		 183 aa  263  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.48 
 
 		 177 aa  258  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.8 
 
 		 184 aa  258  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.18 
 
 		 187 aa  258  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 		 183 aa  254  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.84 
 
 		 172 aa  253  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.84 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.39 
 
 		 196 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.2 
 
 		 178 aa  250  9.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.71 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  67.8 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.28 
 
 		 174 aa  248  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 185 aa  247  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 176 aa  247  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.7 
 
 		 174 aa  246  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 		 176 aa  246  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.78 
 
 		 181 aa  244  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 174 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.28 
 
 		 178 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.52 
 
 		 176 aa  244  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.98 
 
 		 194 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.78 
 
 		 193 aa  243  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 176 aa  243  9e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 174 aa  243  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 174 aa  243  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 174 aa  243  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.89 
 
 		 181 aa  243  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.22 
 
 		 181 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 		 176 aa  242  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 		 174 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 176 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  65.12 
 
 		 176 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 176 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.48 
 
 		 184 aa  241  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 176 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  65.12 
 
 		 176 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 176 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 176 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.79 
 
 		 175 aa  241  3.9999999999999997e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 176 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 176 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.48 
 
 		 184 aa  241  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 		 174 aa  241  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 174 aa  240  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  240  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 		 174 aa  238  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  238  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.92 
 
 		 184 aa  237  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 		 174 aa  237  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00724  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.15 
 
 		 184 aa  235  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.56 
 
 		 184 aa  234  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0463  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 174 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0473  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 174 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.28 
 
 		 178 aa  234  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3867  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 174 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 		 176 aa  234  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 		 188 aa  233  8e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4162  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 174 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.78 
 
 		 190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0131  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.15 
 
 		 178 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0440313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3521  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 174 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0434  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 174 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3699  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 174 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.085186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3254  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.07 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0386  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.07 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 		 184 aa  232  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2916  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.07 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0771725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2173  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.07 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0191  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.07 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0201  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.07 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3432  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.07 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.09 
 
 		 176 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3384  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.64 
 
 		 178 aa  232  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3707  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.64 
 
 		 178 aa  232  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0447  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 		 174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0529  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 		 174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.02 
 
 		 186 aa  231  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0165  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.93 
 
 		 214 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.75 
 
 		 185 aa  230  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0043  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.5 
 
 		 178 aa  230  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0302  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.22 
 
 		 182 aa  230  9e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 175 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.79 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0167  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.36 
 
 		 178 aa  229  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2477  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.93 
 
 		 178 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>