More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0345 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0345  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 96 aa  190  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 96 aa  115  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 96 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4502  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125331  hitchhiker  0.00150559 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 96 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 96 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3687  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 97 aa  110  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.803225  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  55.21 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 97 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3627  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 96 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5660  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00582828  hitchhiker  0.00523053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 		 96 aa  107  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 		 96 aa  107  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  51.04 
 
 		 96 aa  107  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 97 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 97 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 97 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 97 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 105 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  52.08 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 105 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  51.04 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03704  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  52.08 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  55.21 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 97 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  47.92 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  55.21 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  54.17 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  52.08 
 
 		 96 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 		 96 aa  104  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 		 98 aa  105  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  48.96 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  52.08 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 96 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0883  Bvg accessory factor  53.12 
 
 		 96 aa  104  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200777  hitchhiker  0.000120487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  52.08 
 
 		 96 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 96 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  48.96 
 
 		 95 aa  103  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 98 aa  103  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1692  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 95 aa  103  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0464851  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 95 aa  103  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 		 95 aa  103  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  51.04 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  51.04 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  47.92 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1622  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>