More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0342 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0342  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  168  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  8.5444e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  75.29 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  75.29 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  75.29 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  75.29 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  75.29 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  75.29 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  75.29 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  75.29 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  75.29 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0526  50S ribosomal protein L27  75.29 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  76.83 
 
 		 86 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  124  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  121  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  121  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  121  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  72.94 
 
 		 85 aa  121  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  72.94 
 
 		 85 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  72.94 
 
 		 85 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  72.94 
 
 		 85 aa  120  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 85 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  72.94 
 
 		 85 aa  120  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 85 aa  120  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  72.94 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 86 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 86 aa  118  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  117  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  116  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1847  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  75.68 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3034  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 86 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1504  ribosomal protein L27  73.61 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00591698  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  72.97 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 92 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 92 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  75.68 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  76.81 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  71.62 
 
 		 92 aa  107  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 90 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7271  50S ribosomal protein L27  74.65 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 86 aa  106  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0798  ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0702  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1623  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.723727  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2282  ribosomal protein L27  73.61 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  hitchhiker  0.000388636 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  71.01 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5259  50S ribosomal protein L27  76.81 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137345  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  72.46 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0689  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0721  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.980566  normal  0.0233999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0721  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  73.61 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>