More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0304 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0304  ribosomal protein S17  100 
 
 		 87 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000983019  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  53.66 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  52.33 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  56.25 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  55.7 
 
 		 84 aa  100  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 84 aa  100  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0864  ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 83 aa  99.4  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 		 84 aa  96.7  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  53.75 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  54.22 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  50.59 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  50.59 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  49.41 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  53.01 
 
 		 86 aa  95.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 83 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  48.24 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  48.24 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 82 aa  94.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  48.24 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  51.76 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  48.84 
 
 		 87 aa  94.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  53.75 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  48.24 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 82 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  50.59 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  50.59 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2363  ribosomal protein S17  47.06 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.577527  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  52.94 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 82 aa  94  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 84 aa  93.6  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 82 aa  93.2  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3906  ribosomal protein s17  54.05 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281241  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 82 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 82 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 82 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 82 aa  92.8  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 82 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0765  30S ribosomal protein S17  51.76 
 
 		 89 aa  91.7  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000334352  normal  0.110836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  49.43 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 82 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 82 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 82 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 82 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  47.73 
 
 		 101 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  51.22 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0346  30S ribosomal protein S17  52.94 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000061792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  54.79 
 
 		 82 aa  88.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04512  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.003321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  48.81 
 
 		 85 aa  87.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1845  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.018773  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0403  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0378  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  49.35 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 93 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  49.41 
 
 		 87 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 		 86 aa  86.7  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0190  30S ribosomal protein S17  46.43 
 
 		 94 aa  86.7  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00542058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  48.78 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 		 92 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  48.75 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2287  30S ribosomal protein S17  50.68 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000132809  hitchhiker  0.00277508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  48.24 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  54.41 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  52.05 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  50.59 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  45.24 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0332  30S ribosomal protein S17  48.81 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000351608  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  48.72 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>