18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0270 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0270  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.57996e-16  n/a   
 
 
 
NC_011901  Tgr7_0296  hypothetical protein  39.68 
 
 		 132 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1111  hypothetical protein  47.58 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.247105  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2525  hypothetical protein  37.6 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1973  hypothetical protein  39.68 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.182667  normal  0.0517042 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0531  hypothetical protein  47.06 
 
 		 141 aa  97.1  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.721524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2156  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2453  hypothetical protein  38.1 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0295  hypothetical protein  41.96 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0254657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28140  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00031566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1287  hypothetical protein  38.71 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000342569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03119  hypothetical protein  34.96 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1836  hypothetical protein  37.14 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118115  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0088  hypothetical protein  38.83 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4195  hypothetical protein  27.42 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1827  hypothetical protein  33.71 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1042  hypothetical protein  35.94 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0995  hypothetical protein  25.32 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000304176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>