79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0256 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  38.34 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  39.18 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  37.63 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  31.6 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  31.25 
 
 		 212 aa  87  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  35.48 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  32.84 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  30.15 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  29.11 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  25.77 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  30.54 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  32.54 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  30.54 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  30.54 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  32.58 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  28.04 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  25.77 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  32.84 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  27.18 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  34.16 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  29.41 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  26.5 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  25.7 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  23.7 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  31.95 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  31.25 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  25.67 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  23.7 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  29.1 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  29.86 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  28.88 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  32.7 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  27.14 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  33.06 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  31.34 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  30.05 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  28.97 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  28.97 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  26.05 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  28.97 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  28.97 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  28.97 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  39.13 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  27.45 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  24.26 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  23.63 
 
 		 291 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  29.85 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  25.37 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  29.38 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  26.6 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  27.17 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  27.36 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  26.4 
 
 		 259 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  26.4 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  27.36 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  26.4 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  26.96 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  26.4 
 
 		 257 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3264  general secretion pathway protein J  34.09 
 
 		 131 aa  49.3  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089395  hitchhiker  0.00000000000000309054 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  27.49 
 
 		 255 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  30.16 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0714  hypothetical protein  26.01 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0511321  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  27 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  34.33 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0715  hypothetical protein  26.01 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  28.36 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1304  general secretion pathway protein J  26.18 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0680  hypothetical protein  26.97 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.197262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  23.83 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  24.62 
 
 		 251 aa  44.7  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  30.56 
 
 		 247 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  27.78 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  33.33 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  33.8 
 
 		 282 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  32.31 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  40.74 
 
 		 228 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  30.77 
 
 		 231 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>